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cshcgy

金虫 (正式写手)

[求助] 两个反应物 生成两个产物 如何进行过渡态搜索

请问 用MS里的Dmol3搜索过渡态
例如A+B=C+D这种反应,如何进行过渡态搜索
是 将A、B、C、D分别优化,然后 A、B放在一起优化,C、D放在一起优化,确保虚频 ,然后匹配原子,TSsearch吗?
请高手指教!!多谢了

[ Last edited by cshcgy on 2011-7-20 at 20:13 ]
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bjdyadx

银虫 (小有名气)

我也为此事烦恼,希望有大牛能指教.........
.........................................
2楼2011-09-01 08:33:24
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dingniu2

木虫 (正式写手)

健康最重要
3楼2011-09-01 09:07:01
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chemstar

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

4楼2011-10-12 00:53:52
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wangyoucheng

新虫 (初入文坛)

怎么没有高手回答呢? 我也很想知道啊!
5楼2012-04-20 09:19:46
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

★ ★
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教 2012-04-20 10:02:32
A,B,C,D分别优化得到稳定构型,然后设计反应路径,进行过渡态计算;如果是dmol的话,计算得到过渡态后,需要进行过渡态确认

[ Last edited by uuv2010 on 2012-4-20 at 10:03 ]

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2012-04-20 10:01:45
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cshcgy

金虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
1605656楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-04-20 10:01:45:
A,B,C,D分别优化得到稳定构型,然后设计反应路径,进行过渡态计算;如果是dmol的话,计算得到过渡态后,需要进行过渡态确认

用Dmol如果 虚频多于2个怎么办?怎么消去虚频?多谢指点~
7楼2012-04-20 13:20:11
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

如果虚频过多,可以利用搜索到的过渡态作为初态或者末态继续寻找过渡态
8楼2012-04-20 15:00:00
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wangyoucheng

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
1605656楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-04-20 10:01:45:
A,B,C,D分别优化得到稳定构型,然后设计反应路径,进行过渡态计算;如果是dmol的话,计算得到过渡态后,需要进行过渡态确认

是不是要把反应物A和B放在一起呢?这样的话它们之间的距离怎么确定,该离多远才行。不知大哥遇到这样的情况没?
9楼2012-04-20 22:43:38
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zhedaorhuali

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by wangyoucheng at 2012-04-20 22:43:38
是不是要把反应物A和B放在一起呢?这样的话它们之间的距离怎么确定,该离多远才行。不知大哥遇到这样的情况没?...

您好,请问这个问题解决了嘛
人生而自由,却无往而不在枷锁之中
10楼2014-07-30 15:46:20
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