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mirror27

木虫 (正式写手)

[求助] Dmol3输出图形文件分析

TS search结束后的能量,分别是两个类似体系的文件,差别很大,这个应该怎么看怎么分析呢?弱弱问一句,这个图表达的什么意思?

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pro_junjie

禁虫 (正式写手)

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mirror27: 金币+20, ★★★很有帮助, 5 2013-03-31 21:09:19
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2楼2013-03-31 21:04:59
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mirror27

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by pro_junjie at 2013-03-31 21:04:59
第一个图貌似搜索到过渡态了,但是能量比反应物和生成物都低?是否两个结构没有优化?
第二个图是没有找到过渡态的。

是没有优化,优化后的原子好难找~一定要优化吗?那个过渡态标示的地方就是过渡态的能垒吗?
3楼2013-03-31 21:11:14
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pro_junjie

禁虫 (正式写手)

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4楼2013-04-01 01:10:37
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mirror27

木虫 (正式写手)

送鲜花一朵
十分感谢!也就是说必须要先优化获得稳定结构,在搜索过渡态。但我还有个疑问,就是如果原子很多,优化后,反应物和产物结构中的原子会比较混乱,这样进行原子配对时,还要相同位置的一一对应吗?这样的操作好麻烦。。。
5楼2013-04-01 15:55:51
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裴海潮

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by mirror27 at 2013-04-01 15:55:51
十分感谢!也就是说必须要先优化获得稳定结构,在搜索过渡态。但我还有个疑问,就是如果原子很多,优化后,反应物和产物结构中的原子会比较混乱,这样进行原子配对时,还要相同位置的一一对应吗?这样的操作好麻烦。 ...

要的
6楼2014-12-23 13:26:38
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裴海潮

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 裴海潮 at 2014-12-23 13:26:38
要的...

大神!结构优化的时候要在性质栏中选择频率等选项吗?结构优化结束后还要不要再进行能量优化?我是小白,请大神赐教!
7楼2014-12-25 11:04:50
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