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dgcrcat

金虫 (小有名气)

[求助] linux DMol3并行计算为什么不输出热力学性质

用作业提交系统将DMol3任务提交到服务器,properties中选了frequency,运行完成后输出结果中没有热力学性质,最后显示
+++ Entering Vibrations Section +++
Message: Entering vibrations section
Harmonic frequencies will be computed by finite differences.
。。。
然后显示计算成功,就没有了
是不是设定的时候存在什么问题,怎么不输出热力学性质呢?
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uuv2010

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【答案】应助回帖

您选择了frequency就计算频率了啊,根据什么判断运行完成后输出结果中没有热力学性质
2楼2011-09-26 10:04:07
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dgcrcat

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by uuv2010 at 2011-09-26 10:04:07:
您选择了frequency就计算频率了啊,根据什么判断运行完成后输出结果中没有热力学性质

以前在win系统下计算的时候,输出文件的最后会有
STANDARD THERMODYNAMIC QUANTITIES
computed from     25.00 to   1000.00 in steps of   25.00

       T        Entropy   Heat_Capacity   Enthalpy   Free_Energy
      (K)          S  (cal/mol.K) Cp         H  (kcal/mol)  G

                                            (ZPVE is included)

________________________________________________________________

  1   25.00       61.901       14.130      220.531      218.983
  2   50.00       74.172       22.211      220.985      217.276
。。。。。
现在在linux系统里计算却没有这些数据,而且之前在不能并行计算的时候,也是会有这些数据。
现在是可以并行了,但是最后输出文件里却少了这些数据,不知道为什么?
3楼2011-09-26 10:18:55
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uuv2010

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您可以将input文件贴上来大家一起分析
4楼2011-09-26 11:38:11
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dgcrcat

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by uuv2010 at 2011-09-26 11:38:11:
您可以将input文件贴上来大家一起分析

# Task parameters
Calculate                     optimize
Opt_energy_convergence        1.0000e-005
Opt_gradient_convergence      2.0000e-003 A
Opt_displacement_convergence  5.0000e-003 A
Opt_iterations                800
Opt_max_displacement          0.3000 A
Initial_hessian               improved
Symmetry                      on
Max_memory                    2048

# Electronic parameters
Spin_polarization             restricted
Charge                        0
Basis                         dnp
Pseudopotential               none
Functional                    gga(p91)
Aux_density                   octupole
Integration_grid              fine
Occupation                    thermal 0.0050
Cutoff_Global                 3.7000 angstrom
Scf_density_convergence       1.0000e-006
Scf_charge_mixing             0.2000
Scf_iterations                800
Scf_diis                      6 pulay
Cosmo                         ibs
COSMO_Dielectric              78.5400

# Print options
Print                         eigval_last_it

# Calculated properties
Plot                          homo
Plot                          lumo
Plot                          density
Plot                          deformation
Plot                          potential
Nuclear_EFG                   on
Electrostatic_moments         on
Frequency_analysis            on
Grid                          msbox  3 0.2500 0.2500 0.2500 3.0000

其中一个input文件的内容,麻烦大家帮我分析下原因。
5楼2011-09-26 11:43:28
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主


zzy870720z(金币+1): 谢谢建议 2011-09-26 14:51:22
将optimize改为energy试一试
6楼2011-09-26 11:44:47
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dgcrcat

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by uuv2010 at 2011-09-26 11:44:47:
将optimize改为energy试一试

谢谢版主,也已经试过了,还是没有输出热力学性质
7楼2011-09-26 11:47:29
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