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linux DMol3并行计算为什么不输出热力学性质
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用作业提交系统将DMol3任务提交到服务器，properties中选了frequency，运行完成后输出结果中没有热力学性质，最后显示 +++ Entering Vibrations Section +++ Message: Entering vibrations section Harmonic frequencies will be computed by finite differences. 。。。 然后显示计算成功，就没有了 是不是设定的时候存在什么问题，怎么不输出热力学性质呢？ |
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2楼2011-09-26 10:04:07
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以前在win系统下计算的时候，输出文件的最后会有 STANDARD THERMODYNAMIC QUANTITIES computed from 25.00 to 1000.00 in steps of 25.00 T Entropy Heat_Capacity Enthalpy Free_Energy (K) S (cal/mol.K) Cp H (kcal/mol) G (ZPVE is included) ________________________________________________________________ 1 25.00 61.901 14.130 220.531 218.983 2 50.00 74.172 22.211 220.985 217.276 。。。。。 现在在linux系统里计算却没有这些数据，而且之前在不能并行计算的时候，也是会有这些数据。 现在是可以并行了，但是最后输出文件里却少了这些数据，不知道为什么？ |
3楼2011-09-26 10:18:55
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4楼2011-09-26 11:38:11
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# Task parameters Calculate optimize Opt_energy_convergence 1.0000e-005 Opt_gradient_convergence 2.0000e-003 A Opt_displacement_convergence 5.0000e-003 A Opt_iterations 800 Opt_max_displacement 0.3000 A Initial_hessian improved Symmetry on Max_memory 2048 # Electronic parameters Spin_polarization restricted Charge 0 Basis dnp Pseudopotential none Functional gga(p91) Aux_density octupole Integration_grid fine Occupation thermal 0.0050 Cutoff_Global 3.7000 angstrom Scf_density_convergence 1.0000e-006 Scf_charge_mixing 0.2000 Scf_iterations 800 Scf_diis 6 pulay Cosmo ibs COSMO_Dielectric 78.5400 # Print options Print eigval_last_it # Calculated properties Plot homo Plot lumo Plot density Plot deformation Plot potential Nuclear_EFG on Electrostatic_moments on Frequency_analysis on Grid msbox 3 0.2500 0.2500 0.2500 3.0000 其中一个input文件的内容，麻烦大家帮我分析下原因。 |
5楼2011-09-26 11:43:28
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