24小时热门版块排行榜    

查看: 1716  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

dgcrcat

金虫 (小有名气)

[求助] linux DMol3并行计算为什么不输出热力学性质

用作业提交系统将DMol3任务提交到服务器,properties中选了frequency,运行完成后输出结果中没有热力学性质,最后显示
+++ Entering Vibrations Section +++
Message: Entering vibrations section
Harmonic frequencies will be computed by finite differences.
。。。
然后显示计算成功,就没有了
是不是设定的时候存在什么问题,怎么不输出热力学性质呢?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dgcrcat

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by uuv2010 at 2011-09-26 10:04:07:
您选择了frequency就计算频率了啊,根据什么判断运行完成后输出结果中没有热力学性质

以前在win系统下计算的时候,输出文件的最后会有
STANDARD THERMODYNAMIC QUANTITIES
computed from     25.00 to   1000.00 in steps of   25.00

       T        Entropy   Heat_Capacity   Enthalpy   Free_Energy
      (K)          S  (cal/mol.K) Cp         H  (kcal/mol)  G

                                            (ZPVE is included)

________________________________________________________________

  1   25.00       61.901       14.130      220.531      218.983
  2   50.00       74.172       22.211      220.985      217.276
。。。。。
现在在linux系统里计算却没有这些数据,而且之前在不能并行计算的时候,也是会有这些数据。
现在是可以并行了,但是最后输出文件里却少了这些数据,不知道为什么?
3楼2011-09-26 10:18:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

【答案】应助回帖

您选择了frequency就计算频率了啊,根据什么判断运行完成后输出结果中没有热力学性质
2楼2011-09-26 10:04:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

您可以将input文件贴上来大家一起分析
4楼2011-09-26 11:38:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dgcrcat

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by uuv2010 at 2011-09-26 11:38:11:
您可以将input文件贴上来大家一起分析

# Task parameters
Calculate                     optimize
Opt_energy_convergence        1.0000e-005
Opt_gradient_convergence      2.0000e-003 A
Opt_displacement_convergence  5.0000e-003 A
Opt_iterations                800
Opt_max_displacement          0.3000 A
Initial_hessian               improved
Symmetry                      on
Max_memory                    2048

# Electronic parameters
Spin_polarization             restricted
Charge                        0
Basis                         dnp
Pseudopotential               none
Functional                    gga(p91)
Aux_density                   octupole
Integration_grid              fine
Occupation                    thermal 0.0050
Cutoff_Global                 3.7000 angstrom
Scf_density_convergence       1.0000e-006
Scf_charge_mixing             0.2000
Scf_iterations                800
Scf_diis                      6 pulay
Cosmo                         ibs
COSMO_Dielectric              78.5400

# Print options
Print                         eigval_last_it

# Calculated properties
Plot                          homo
Plot                          lumo
Plot                          density
Plot                          deformation
Plot                          potential
Nuclear_EFG                   on
Electrostatic_moments         on
Frequency_analysis            on
Grid                          msbox  3 0.2500 0.2500 0.2500 3.0000

其中一个input文件的内容,麻烦大家帮我分析下原因。
5楼2011-09-26 11:43:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-26 21:41 by xxniao123
[基金申请] 基金不中,共勉 +4 eulota 2026-08-26 4/200 2026-08-26 21:29 by 木风9012
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见