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cherrily木虫 (正式写手)
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【求助】Dmol3计算outmol分析电子密度，谢谢！ 已有8人参与
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几何优化模型之后，我计算了轨道，得到结果outmol文件 第一个问题： 里面显示如下： Fermi Energy 0.15390Ha 4.188eV -kTS_e= -0.014745Ha HOMO is orbital number 40 LUMO is orbital number 41 state eigenvalue occupation (au) (ev) 1 - 1 a -18.607907 -506.347 1.000 2 + 1 a -18.607857 -506.346 1.000 3 - 2 a -18.607726 -506.342 1.000 4 + 2 a -18.607658 -506.340 1.000 。 。 。 34 + 17 a -0.079579 -2.165 1.000 35 - 18 a -0.079369 -2.160 1.000 36 + 18 a -0.079285 -2.157 1.000 37 - 19 a -0.077259 -2.102 1.000 38 + 19 a -0.077139 -2.099 1.000 39 + 20 a -0.076044 -2.069 1.000 40 - 20 a -0.075971 -2.067 1.000 41 - 21 a 0.161169 4.386 0.189 42 + 21 a 0.161405 4.392 0.182 43 - 22 a 0.162940 4.434 0.141 44 + 22 a 0.163105 4.438 0.137 我查看了以前的老贴子，说电子密度就是轨道的平方，在import之后我是可以得到HOMO的图的，这里显示的特征值是不是就是轨道函数呢？ 第二个问题： Total E (au) Binding E (au) Convergence Time (m) Iter ----------------------------------------------------------------------------- Ef -305.5343502 -1.2624257 0.83E-04 0.623 26 binding energy -1.262426Ha -34.35236eV -792.200kcal/mol -3314.564kJ/mol 这个Ef的能量是不是就是费米能级的能量？那我理解为HOMO的能量，对不对呢？ 第三个问题： 上一个问题的数据中，Binding E的数值是费米能级的什么结合能？ 第四个问题： 计算布居结果如下 Mulliken population analysis Mulliken atomic charges: charge spin O( 1) -0.592 0.001 H( 2) 0.181 -0.004 H( 3) 0.174 -0.004 O( 4) -0.595 -0.001 H( 5) 0.162 0.005 H( 6) 0.172 0.005 请问这个spin的数值能说明什么问题？这个例子里面的数据有说明了什么? 第五个问题： Plotting output: property: file name: DMol3 total electron density 4H2O-_density.grd orbital 40 20 -a -0.0760 1.00 4H2O-_homo.grd orbital 41 21 -a 0.1614 0.18 4H2O-_lumo.grd 这个里面显示的 -0.0760和0.1614 和第一个问题里面的轨道的特征值很相近，是不是就是特征值？如果是，为什么有一点差别？这是同一次收敛计算的结果啊。 如果不是，那是什么呢？ 刚刚学习MS，对于outmol文件有很多不明白，问题问的会比较低一点，请大家不吝赐教，谢谢，已经发愁好几天了。 |
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3):谢谢专家指导，辛苦了 2010-06-10 12:12:22
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1) 分子轨道波函数由各个原子的波函数线性组合而成，这里的值是对应的分子轨道波函数的本征值 2)你说的这个值是体系的总能 3）结合能已经有人回答了 4）这个数据里的charge说明了这个原子的电荷得失情况，正的为失去电子，负的为得到电子。spin那一项说明原子的自旋自矩（这个里面不考虑轨道磁矩）。正负为磁矩的方向 5）-0.0760和0.1614 和前面计算的是一样的，只是下面自动保留到小数点后四位，你如果看轨道系统的话，也会看到，本征值和第一个问题中的数据是对应的，只是保留到小数后三位。 |
9楼2010-06-10 09:48:01
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