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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » Dmol3输出图形文件分析
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mirror27

木虫 (正式写手)

[求助] Dmol3输出图形文件分析

TS search结束后的能量，分别是两个类似体系的文件，差别很大，这个应该怎么看怎么分析呢？弱弱问一句，这个图表达的什么意思？

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mirror27

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1楼 2013-03-31 20:11:11
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mirror27

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by pro_junjie at 2013-03-31 21:04:59
第一个图貌似搜索到过渡态了，但是能量比反应物和生成物都低？是否两个结构没有优化？
第二个图是没有找到过渡态的。

是没有优化，优化后的原子好难找~一定要优化吗？那个过渡态标示的地方就是过渡态的能垒吗？
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3楼2013-03-31 21:11:14
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mirror27

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
十分感谢！也就是说必须要先优化获得稳定结构，在搜索过渡态。但我还有个疑问，就是如果原子很多，优化后，反应物和产物结构中的原子会比较混乱，这样进行原子配对时，还要相同位置的一一对应吗？这样的操作好麻烦。。。
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5楼2013-04-01 15:55:51
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