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mirror27

木虫 (正式写手)

[求助] Dmol3输出图形文件分析

TS search结束后的能量，分别是两个类似体系的文件，差别很大，这个应该怎么看怎么分析呢？弱弱问一句，这个图表达的什么意思？

2.jpg



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mirror27

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1楼 2013-03-31 20:11:11
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pro_junjie

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mirror27: 金币+20, ★★★很有帮助, 5 2013-03-31 21:09:19
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mirror27
2楼2013-03-31 21:04:59
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mirror27

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by pro_junjie at 2013-03-31 21:04:59
第一个图貌似搜索到过渡态了，但是能量比反应物和生成物都低？是否两个结构没有优化？
第二个图是没有找到过渡态的。

是没有优化，优化后的原子好难找~一定要优化吗？那个过渡态标示的地方就是过渡态的能垒吗？
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3楼2013-03-31 21:11:14
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pro_junjie

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
4楼2013-04-01 01:10:37
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mirror27

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
十分感谢！也就是说必须要先优化获得稳定结构，在搜索过渡态。但我还有个疑问，就是如果原子很多，优化后，反应物和产物结构中的原子会比较混乱，这样进行原子配对时，还要相同位置的一一对应吗？这样的操作好麻烦。。。
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5楼2013-04-01 15:55:51
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裴海潮

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by mirror27 at 2013-04-01 15:55:51
十分感谢！也就是说必须要先优化获得稳定结构，在搜索过渡态。但我还有个疑问，就是如果原子很多，优化后，反应物和产物结构中的原子会比较混乱，这样进行原子配对时，还要相同位置的一一对应吗？这样的操作好麻烦。 ...

要的
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6楼2014-12-23 13:26:38
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裴海潮

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 裴海潮 at 2014-12-23 13:26:38
要的...

大神！结构优化的时候要在性质栏中选择频率等选项吗？结构优化结束后还要不要再进行能量优化？我是小白，请大神赐教！
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7楼2014-12-25 11:04:50
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