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richard0820

铜虫 (初入文坛)

[求助] 崩溃!!易错pcr重组质粒构建总是失败!!求大神指导! 已有3人参与

小虫做的是酶的定向进化,主要是采用易错pcr技术实施目的片段的随机突变,完了插入表达载体,表达蛋白测定性质。
    目前在构建重组载体阶段,可是构建了一个月了就是不成功,老板又在催,心里那个急啊!具体情况是这样的-
    载体是我们实验室事先构建好的pet-28a,含有目的片段,我要做的就是先用易错pcr把目的片段p出来,主要是通过改变pcr体系中的各组分比例和浓度,然后纯化,在和同样的载体经过双酶切,连接,转化。具体的体系:
双酶切  用的是thermo scientic 的Nhel和Xhol,这两种酶在同一缓冲液中活性不同,xhol在最适Nhel缓冲液中最大活性只有50%,我通过加倍用量进行酶切,体系是1ug样品加0.5ulNhel  1ulXhol,酶切5h,经过单双酶切验证,载体是切完全了的。
连接   用的是takara的t4连接酶,体系是按照说明书来的,16 度过夜
酶切后都是经过胶回收的,回收后浓度有50+
转化  转的DH 设置了感受态空白对照,经酶切胶回收后不加连接酶的空载,和连接产物转化,转化全部连接液25ul,操作没问题,以前做正常质粒都是成功的,结果是感受态长得好,空载不长,连接产物有时长很多单克隆,有时就一两个,经菌落pcr验证全是假阳性,每个板挑了10个克隆。菌落pcr技术没问题。
     问题:  空载没长,说明几乎没有载体自连,实验板长了有两种情况:1  连接成功,那菌落pcr应有条带
2  连接不成功,载体又没有自连,那哪来的克隆??
好吧,就算不考虑空载对照,就算酶切不彻底,出现单酶切,载体自连了,但是我的载体本身是含有正常目的片段的啊,那应该p的出来啊??尽管没有插入我需要的错误片段。
为啥又出现克隆,又p不出条带呢???整不明白?
  求各位大神指导哇,感激不尽!!!

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

[ Last edited by richard0820 on 2014-7-14 at 14:09 ]
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厚德求是

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
richard0820(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-10-30 19:23:05
有点不明白你说的“结果是感受态长得好,空载不长,连接产物有时长很多单克隆,有时就一两个”,意思是说感受态空白对照长了,加切胶回收但不连接的没长,然后加链接产物长得时好时坏?我猜想是不是你的板子的抗性出了问题,并且使用的感受态细胞液有问题。有重复过试验吗?每次i都是这样?
2楼2014-08-10 13:59:55
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neer

铁虫 (初入文坛)

你问题解决了吗?我也遇到类似问题,快愁死了
3楼2014-10-30 17:07:29
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淘七九懒

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你可以尝试用一步克隆法,很好做,效率也很高!
4楼2015-09-06 11:03:52
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janjanjanjan

新虫 (初入文坛)

我的也是,感觉空载好多,现在解决了么?

发自小木虫Android客户端
5楼2015-10-08 10:32:43
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janjanjanjan

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 淘七九懒 at 2015-09-06 11:03:52
你可以尝试用一步克隆法,很好做,效率也很高!

诺唯赞的一步克隆么,我在用,我们实验室有的人做,阳性长了好多,我的长的少不说,假阳性也很多,这方面的问题你遇到过么

发自小木虫Android客户端
6楼2015-10-08 10:34:48
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15222569263

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by janjanjanjan at 2015-10-08 10:34:48
诺唯赞的一步克隆么,我在用,我们实验室有的人做,阳性长了好多,我的长的少不说,假阳性也很多,这方面的问题你遇到过么
...

你好,问一下你们实验室用诺唯赞一步克隆可以用在随机突变易错PCR吗?我看的他们的那个产品介绍说用于定点突变,没说可以用于随机突变啊。谢谢啦
7楼2016-03-17 21:20:13
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L秋爱学习

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by janjanjanjan at 2015-10-08 10:32:43
我的也是,感觉空载好多,现在解决了么?

我现在做也是 请问前辈是怎么解决的呀 有找到假阳性的原因吗

发自小木虫Android客户端
8楼2017-11-19 10:34:25
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本帖内容被屏蔽

9楼2022-11-29 18:09:58
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