| 查看: 1528 | 回复: 5 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
小钱不帅铁杆木虫 (正式写手)
奋青
|
[求助]
求大神帮助小弟构建一下这个菌株序列的进化树 已有1人参与
|
||
| 小弟本科毕业论文有菌株鉴定，可是系统进化树老是做的不理想，快要毕业答辩了，很急，求大神帮助，小弟在这里不胜感激。菌株名称为BLy，序列如下：CCCCATTTGGCTTGCCTATACTGCAGTCGAGCGGACCGACGGGAGCTTGCTCCCTTAGGTCAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTGTAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATGCTTGATTGAACCGCATGGTTCAATCATAAAAGGTGGCTTTTAGCTACCACTTACAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGTTTTCGGATCGTAAAACTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTACCGTTCGAATAGGGCGGCACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCAGGCGGTTTCTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCCCGGCTCAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGGGAACTTGAGTGCAGAAGAGGAGAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCTGCAGCAAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGACTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGACAACCCTAGAGATAGGGCTTCCTCTTCGGGGGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCG |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有70人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 已经用CLustalX软件比对完同源序列，怎么用MEGA软件做进化树
已经有4人回复
- 做进化树使用完整的DNA序列，还是一个片段？
已经有6人回复
- 怎么做菌种鉴定
已经有20人回复
- 系统进化树和聚类分析中如何选择的菌株？有图有真相，求解
已经有5人回复
- 请教各位大神帮忙分下类！！！
已经有8人回复
- 求大神们帮我解决一个关于修改系统进化树字体的问题
已经有18人回复
- 哪位高手可以告诉我构建进化树的序列如何选择啊
已经有3人回复
- 利用MEGA5.2对一株细菌16SrDNA构建系统进化树，结果发现与BLASTN结果差的好远
已经有7人回复
- 系统进化树分析
已经有6人回复
- 序列比对软件的选择和进化树制作
已经有9人回复
- 你们做蛋白质同源进化树一般怎么选序列啊？
已经有3人回复
- 进化树及序列上传相关问题
已经有9人回复
- 各位大神看看我的进化树，怎么建都建不好
已经有3人回复
- 构建进化树过程中，我如何把我的菌的序列 和我 选择同源的序列 编辑在一起进行比对？
已经有5人回复
- 细菌多样性，构建系统进化树中如何选择outgroup？急！！！！！！！
已经有15人回复
- 请问如何将进化树中的菌种名称显示出来？
已经有20人回复
- Heeelp: Mega4建进化树，用的是核酸推导出的氨基酸序列,有两选项不知道如何选
已经有4人回复
- 关于进化树序列选择的问题
已经有4人回复
- 【求助/交流】构建进化树前序列的处理问题
已经有5人回复
- 【求助/交流】氨基酸序列不等长是不是不能用MEGA构建进化树啊？
已经有5人回复
- 【求助/交流】做进化树时如何选择菌株？
已经有10人回复
- 【求助/交流】16s进化树+细菌鉴定 达人 请进~~~
已经有5人回复
【答案】应助回帖
★ ★ ★
小钱不帅(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-06-19 09:12:44
小钱不帅(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-06-19 09:12:44
|
树不行很多原因，序列修剪的如何，用ncbi上blast的结果中的序列跑下试试，祝福！！要以后想学这个可以深入的学习下，有很多软件要学，clustal，muscle比对序列，推荐几种主流的建树软件paup，phyml，mrbayes，这几种软件基本满足各种方法，mp，ml，bi的需要了，nj法在解决内群关系上也不错，不过是无根树。mega都算了。。。只能呵呵两字形容，最大的好处就是可视化强，能够反映序列的基本信息，算遗传距离什么的，做树。。。呵呵。。。 |
4楼2014-06-17 14:11:55
2楼2014-06-17 08:21:20
小钱不帅
铁杆木虫 (正式写手)
奋青
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 6157.9
- 散金: 154
- 帖子: 938
- 在线: 115.7小时
- 虫号: 2300806
- 注册: 2013-02-26
- 性别: GG
- 专业: 纳米生物学
3楼2014-06-17 09:44:38
小钱不帅
铁杆木虫 (正式写手)
奋青
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 6157.9
- 散金: 154
- 帖子: 938
- 在线: 115.7小时
- 虫号: 2300806
- 注册: 2013-02-26
- 性别: GG
- 专业: 纳米生物学
5楼2014-06-18 16:45:20
