24小时热门版块排行榜    

查看: 2432  |  回复: 9

zhen_fang

银虫 (正式写手)

[求助] Autodock的MGLtool软件在导入配体分子时候出现异常,怎么解决 已有1人参与

我的配体分子是多肽AAPF,已经放在附件。

另外附图一张,左边是图形软件打开多肽的形状,右边是用安装MGLtool软件的GUI界面打开。右边另类的模型直接导致后续的autoaock操作失败阿,很急,求大神指点阿,我已经熬夜反复弄了Linux或者Win系统都失败,快难过死了

Autodock的MGLtool软件在导入配体分子时候出现异常,怎么解决
搜狗截图14年06月16日0136_1.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhen_fang

银虫 (正式写手)

这是多肽的附件

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 40817-33-2.pdb
  • 2014-06-16 01:47:06, 4.08 K
2楼2014-06-16 01:47:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhen_fang

银虫 (正式写手)

没人回复
3楼2014-06-16 10:30:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pymol

捐助贵宾 (正式写手)


配体没有经过能量最小化优化吗?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2014-06-16 11:27:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhen_fang

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by pymol at 2014-06-16 11:27:07
配体没有经过能量最小化优化吗?

配体也要优化吗?优化之后导入的结构也会出现这样的差异吧?我把没有优化的蛋白结构导入就没有发生这样的变化。总之,谢谢了
5楼2014-06-16 15:07:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

earth

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-06-17 16:00:20
把配体原始坐标和优化后坐标贴一下看看。
6楼2014-06-17 05:56:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhen_fang

银虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by earth at 2014-06-17 05:56:21
把配体原始坐标和优化后坐标贴一下看看。

昨天自己问题已解决,多谢拉
7楼2014-06-17 08:57:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang360

新虫 (正式写手)

最近这几天开始学习autodock,不停出现问题,晕死
8楼2016-07-09 17:02:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

二叉树

新虫 (初入文坛)

请问楼主是怎么解决的呀,我也遇到了同样的问题,急求

发自小木虫Android客户端
9楼2018-01-15 11:17:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuyaqiao

新虫 (初入文坛)

我是在打开受体分子的时候即macromolecule>set grid filename读取不了受体分子,求解
10楼2018-02-28 10:04:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhen_fang 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +4 两三岁ss 2026-09-14 4/200 2026-09-14 20:29 by 班主任的同桌
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-14 18:01 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-14 17:49 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-14 17:48 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-14 17:25 by Aj1rhIDL5ixY
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:12 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:00 by Aj1rhIDL5ixY
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:57 by Aj1rhIDL5ixY
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:48 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:45 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-14 15:21 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:13 by Aj1rhIDL5ixY
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 15:09 by Aj1rhIDL5ixY
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:01 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 14:57 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 10:01 by 23jxep3nCNZb
[考博] 西北工业大学材料学院电化学传感与催化课题组招收2027年推免研究生、博士生、博士后 +3 马方园 2026-09-10 4/200 2026-09-14 09:29 by Chem张zz
[考博] 27秋季材料博士申请求助 10+3 Cahal1 2026-09-11 4/200 2026-09-14 08:50 by 北京莱茵编辑
[有机交流] 科研求助 10+4 我吃一只鱼 2026-09-07 4/200 2026-09-10 08:32 by 0940628
信息提示
请填处理意见