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by小宁木虫 (初入文坛)
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关于真菌次级代谢产物的生物合成，真菌的基因组未知，怎样找合成酶的基因呢？ 已有2人参与
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这个真菌次级代谢产物的合成途径以及关键酶都没有人做过，要先打液相，液质联用找中间代谢物么？可是我想从基因的角度做。大概推测了下，它应该属于聚酮合成途径，聚酮合酶 I 型。我想先找第一步的合成酶基因，应该怎么做呢？ 希望大牛们帮助下啊~~十分感激！ |
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luwei13566
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克隆大虾
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by小宁
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3楼2014-06-02 12:39:32
luwei13566
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【答案】应助回帖
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kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-06-03 16:10:48
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-06-03 16:10:48
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LZ你现在关键问题是代谢途径不知道，这个代谢的起始底物是什么啊？代谢的终产物你知道是什么物质吗？如果知道终产物完全可以由产物反推酶的。如果不知道产物的话这里加个HPLC其实蛮重要的，只不过标准品要多找些来。 LZ你说它应该属于聚酮合成途径， I 型聚酮合酶。这个有没有可靠的文献作为依据的，还是你自己推测的。如果是有可靠的文献佐证，那你可以去KEGG上找 I 型聚酮合酶，KEGG上好多酶都是附带代谢途径的，说不定别人有过报道或者代谢途径部分确定了的。一旦找到代谢途径，各种酶名字一清楚，到NCBI上找基因就简单了，要是没基因那就看看亲缘关系比较近的菌株中有没有报道。这里最重要的问题还是你的依据充分不充分，依据不充分就有可能你找的酶就和你的代谢产物没关系。 |
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by小宁4楼2014-06-03 12:57:38
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