应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » ncbi比对分析，哪位大神可以帮助我分析一下这个情况是怎么回事啊？
91/1返回列表
查看: 1877  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chendi1989

铁虫 (初入文坛)

[求助] ncbi比对分析，哪位大神可以帮助我分析一下这个情况是怎么回事啊？ 已有2人参与

ncbi比对分析，哪位大神可以帮助我分析一下这个情况是怎么回事啊？怎么zip基因家族比对会不完全？

ncbi比对分析，哪位大神可以帮助我分析一下这个情况是怎么回事啊？
图片2.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
吾生也有涯，而知也无涯！
1楼 2014-05-22 17:36:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-05-23 22:03:01
为什么说zip基因家族比对不完全？比对结果只是说你的序列里有一段编码zip基因家族蛋白结构域。
赞一下 回复此楼
2楼2014-05-23 00:49:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chendi1989: 金币+1 2014-05-23 10:34:20
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-05-23 22:03:13
图上说这个图是从120个BLAST 结果产生的，而这个BLAST结果取决于你递交的序列。这个只能说明你的序列只是zip的部分
赞一下 回复此楼
3楼2014-05-23 07:10:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chendi1989

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-23 00:49:59
为什么说zip基因家族比对不完全？比对结果只是说你的序列里有一段编码zip基因家族蛋白结构域。

我的这段序列是ORF,比对出来的zip基因家族中间怎么会有空的？他们的都没这种情况啊？郁闷
赞一下 回复此楼
吾生也有涯，而知也无涯！
4楼2014-05-23 10:13:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chendi1989

铁虫 (初入文坛)
我的这段序列是ORF,比对出来的zip基因家族中间怎么会有空的？他们的都没这种情况啊？郁闷
赞一下 回复此楼
吾生也有涯，而知也无涯！
5楼2014-05-23 10:13:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-05-23 22:03:22
可能你发现了一个新的isoform，少了一个exon
赞一下 回复此楼
6楼2014-05-23 18:50:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
chendi1989: 金币+3, ★有帮助 2014-05-26 20:13:54
引用回帖:
4楼: Originally posted by chendi1989 at 2014-05-23 10:13:31
我的这段序列是ORF,比对出来的zip基因家族中间怎么会有空的？他们的都没这种情况啊？郁闷...

我认为出现空的原因是blast服务器在比对你的序列时，认为你的序列中存在两个非复杂区（就是那两个蓝色位置），而非复杂区在分析结构域时会被过滤，所以比对结果显示时就有一段空。
赞一下 回复此楼
7楼2014-05-24 00:26:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chendi1989

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-24 00:26:59
我认为出现空的原因是blast服务器在比对你的序列时，认为你的序列中存在两个非复杂区（就是那两个蓝色位置），而非复杂区在分析结构域时会被过滤，所以比对结果显示时就有一段空。...

弱弱的问一句，什么叫非复杂区？有什么作用？
赞一下 回复此楼
吾生也有涯，而知也无涯！
8楼2014-05-26 08:32:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by chendi1989 at 2014-05-26 08:32:47
弱弱的问一句，什么叫非复杂区？有什么作用？...

一般认为没什么作用，所以搜索结构域时才被过滤，通常认为有功能的区域或位点应具有特定的模式或序列。
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2014-05-26 20:42:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chendi1989 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 266求调剂 +5 阳阳哇塞 2026-03-14 9/450 2026-03-18 15:05 by stone_128
[考研] 085601专硕，总分342求调剂，地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 一志愿西南交大，求调剂 +4 材化逐梦人 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:22 by 007_lilei
[考研] 一志愿985，本科211，0817化学工程与技术319求调剂 +6 Liwangman 2026-03-15 6/300 2026-03-18 13:21 by 尽舜尧1
[教师之家] 焦虑 +8 水冰月月野兔 2026-03-13 11/550 2026-03-18 13:10 by 水冰月月野兔
[考研] 0854，计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考研] 0703化学求调剂 总分331 +3 ZY-05 2026-03-13 3/150 2026-03-18 10:58 by macy2011
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考研] 268求调剂 +8 一定有学上- 2026-03-14 9/450 2026-03-17 17:47 by laoshidan
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 278求调剂 +3 Yy7400 2026-03-13 3/150 2026-03-17 08:24 by laoshidan
[基金申请] 今年的国基金是打分制吗？ 50+3 zhanghaozhu 2026-03-14 3/150 2026-03-16 17:07 by 北京莱茵润色
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历，论文在投 +7 腻腻gk 2026-03-14 7/350 2026-03-16 10:12 by houyaoxu
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧， 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 材料与化工求调剂一志愿 985 总分 295 +8 dream…… 2026-03-12 8/400 2026-03-13 22:17 by 星空星月
[考研] 315求调剂 +9 小羊小羊_ 2026-03-11 10/500 2026-03-13 21:13 by SXNU李老师
[考研] 考研调剂 +4 芬达46 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:04 by ruiyingmiao
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭