应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » ncbi比对分析，哪位大神可以帮助我分析一下这个情况是怎么回事啊？
91/1返回列表
查看: 1919  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chendi1989

铁虫 (初入文坛)

[求助] ncbi比对分析，哪位大神可以帮助我分析一下这个情况是怎么回事啊？ 已有2人参与

ncbi比对分析，哪位大神可以帮助我分析一下这个情况是怎么回事啊？怎么zip基因家族比对会不完全？

ncbi比对分析，哪位大神可以帮助我分析一下这个情况是怎么回事啊？
图片2.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
吾生也有涯，而知也无涯！
1楼 2014-05-22 17:36:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-05-23 22:03:01
为什么说zip基因家族比对不完全？比对结果只是说你的序列里有一段编码zip基因家族蛋白结构域。
赞一下 回复此楼
2楼2014-05-23 00:49:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chendi1989: 金币+1 2014-05-23 10:34:20
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-05-23 22:03:13
图上说这个图是从120个BLAST 结果产生的，而这个BLAST结果取决于你递交的序列。这个只能说明你的序列只是zip的部分
赞一下 回复此楼
3楼2014-05-23 07:10:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chendi1989

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-23 00:49:59
为什么说zip基因家族比对不完全？比对结果只是说你的序列里有一段编码zip基因家族蛋白结构域。

我的这段序列是ORF,比对出来的zip基因家族中间怎么会有空的？他们的都没这种情况啊？郁闷
赞一下 回复此楼
吾生也有涯，而知也无涯！
4楼2014-05-23 10:13:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chendi1989

铁虫 (初入文坛)
我的这段序列是ORF,比对出来的zip基因家族中间怎么会有空的？他们的都没这种情况啊？郁闷
赞一下 回复此楼
吾生也有涯，而知也无涯！
5楼2014-05-23 10:13:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-05-23 22:03:22
可能你发现了一个新的isoform，少了一个exon
赞一下 回复此楼
6楼2014-05-23 18:50:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
chendi1989: 金币+3, ★有帮助 2014-05-26 20:13:54
引用回帖:
4楼: Originally posted by chendi1989 at 2014-05-23 10:13:31
我的这段序列是ORF,比对出来的zip基因家族中间怎么会有空的？他们的都没这种情况啊？郁闷...

我认为出现空的原因是blast服务器在比对你的序列时，认为你的序列中存在两个非复杂区（就是那两个蓝色位置），而非复杂区在分析结构域时会被过滤，所以比对结果显示时就有一段空。
赞一下 回复此楼
7楼2014-05-24 00:26:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chendi1989

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-24 00:26:59
我认为出现空的原因是blast服务器在比对你的序列时，认为你的序列中存在两个非复杂区（就是那两个蓝色位置），而非复杂区在分析结构域时会被过滤，所以比对结果显示时就有一段空。...

弱弱的问一句，什么叫非复杂区？有什么作用？
赞一下 回复此楼
吾生也有涯，而知也无涯！
8楼2014-05-26 08:32:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by chendi1989 at 2014-05-26 08:32:47
弱弱的问一句，什么叫非复杂区？有什么作用？...

一般认为没什么作用，所以搜索结构域时才被过滤，通常认为有功能的区域或位点应具有特定的模式或序列。
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2014-05-26 20:42:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chendi1989 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿2110，化学学硕310分，本科重点双非求调剂 +13 努力奋斗112 2026-04-08 13/650 2026-04-09 00:27 by Evan_Liu
[考研] 一志愿华南师范大学0702物理学305调剂 +4 念常安 2026-04-07 6/300 2026-04-08 22:53 by bljnqdcc
[考研] 298求调剂 +6 钉叮咚冬瓜 2026-04-07 8/400 2026-04-08 10:51 by 中飞院空管学院�
[考研] 288环境专硕,求调材料方向 +35 lllllos 2026-04-04 39/1950 2026-04-07 23:24 by 一只好果子?
[考研] 323求调剂 +3 林zlu 2026-04-07 4/200 2026-04-07 23:21 by lbsjt
[考研] 一志愿西南090202求调剂 +4 在线求有学上 2026-04-07 4/200 2026-04-07 19:47 by biomichael
[考研] 085602调剂 初试总分335 +3 19123253302 2026-04-06 3/150 2026-04-07 18:00 by jp9609
[考研] 277求调剂 数一104分 +9 瓶子PZ 2026-04-05 14/700 2026-04-07 17:52 by 蓝云思雨
[考研] 0703调剂 +16 拾玖壹 2026-04-04 18/900 2026-04-07 12:49 by flydream1314
[考研] 材料调剂 +13 一样YWY 2026-04-05 14/700 2026-04-07 09:51 by piklet
[考研] 调剂 +8 熊二想上岸 2026-04-04 8/400 2026-04-05 05:27 by houyaoxu
[考研] 能动调剂326专硕 +4 wan112233 2026-04-04 4/200 2026-04-04 22:47 by yu221
[考研] 325求调剂 +4 春风不借意 2026-04-04 4/200 2026-04-04 22:08 by 啵啵啵0119
[考研] 085600调剂 +4 1amJJ 2026-04-02 4/200 2026-04-04 21:53 by hemengdong
[考研] 求调剂 +3 ffyyu 2026-04-02 3/150 2026-04-04 19:03 by 蓝云思雨
[考研] 考研调剂 +3 Draa 2026-04-03 3/150 2026-04-03 17:37 by hgwz7468
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:06 by arrow8852
[考研] 初试成绩337找调剂 +3 ??? ?. ? 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:43 by 土木硕士招生
[考研] 071000生物学调剂 +8 知昭蔓 2026-04-02 8/400 2026-04-03 10:36 by macy2011
[考研] 一志愿安徽大学0817化学工程与技术，求调剂 +14 我不是只因 2026-04-02 15/750 2026-04-03 09:49 by 蓝云思雨
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭