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aloon111

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】NCBI比对后如何找模式菌株的生理生化特征? 已有3人参与

NCBI比对后,选模式菌株做进化树,如何找模式菌株的生理生化特征?
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汇天下之贤
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圆圆9880

铜虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我也有此疑问,怎样在BLAST比对出跟你最近的种,有时比出来相似性一样的很多。
2楼2010-12-02 16:38:32
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wcg129

禁虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
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3楼2010-12-02 17:03:33
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aloon111

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 圆圆9880 at 2010-12-02 16:38:32:
我也有此疑问,怎样在BLAST比对出跟你最近的种,有时比出来相似性一样的很多。

做进化树啊。。。
汇天下之贤
4楼2010-12-04 09:26:22
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aloon111

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by wcg129 at 2010-12-02 17:03:33:
比对结果后就根据结果找国标

做进化树的模式菌株都是外国的,拿国标没法比较。国标的有没有16SrDNA序列?
汇天下之贤
5楼2010-12-04 09:34:12
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圆圆9880

铜虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
如果比较16SrRNA,构树用EzTAXON还好用点,用BLAST麻烦,但是单构树就可以确定?
6楼2010-12-06 10:36:05
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