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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】NCBI比对后如何找模式菌株的生理生化特征？
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aloon111

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】NCBI比对后如何找模式菌株的生理生化特征？ 已有3人参与

NCBI比对后，选模式菌株做进化树，如何找模式菌株的生理生化特征？
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汇天下之贤
1楼 2010-12-01 19:43:42
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圆圆9880

铜虫 (初入文坛)
★
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我也有此疑问，怎样在BLAST比对出跟你最近的种，有时比出来相似性一样的很多。
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2楼2010-12-02 16:38:32
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wcg129

禁虫 (著名写手)
★
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本帖内容被屏蔽
3楼2010-12-02 17:03:33
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aloon111

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 圆圆9880 at 2010-12-02 16:38:32:
我也有此疑问，怎样在BLAST比对出跟你最近的种，有时比出来相似性一样的很多。

做进化树啊。。。
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汇天下之贤
4楼2010-12-04 09:26:22
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aloon111

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by wcg129 at 2010-12-02 17:03:33:
比对结果后就根据结果找国标

做进化树的模式菌株都是外国的，拿国标没法比较。国标的有没有16SrDNA序列?
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汇天下之贤
5楼2010-12-04 09:34:12
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圆圆9880

铜虫 (初入文坛)
★
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如果比较16SrRNA,构树用EzTAXON还好用点，用BLAST麻烦，但是单构树就可以确定？
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6楼2010-12-06 10:36:05
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