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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » NCBI真菌ITS序列上传问题
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smile901018

金虫 (小有名气)

[求助] NCBI真菌ITS序列上传问题 已有2人参与

各位高手想问一下在NCBI上上传过真菌ITS序列的，我用的是ITS的通用引物ITS4,ITS5，不知道扩增的是哪一段啊，note写/note="contains 18S ribosomal RNA, internal transcribed spacer 1, 5.8S ribosomal RNA, internal transcribed spacer2, and 28S ribosomal RNA"这样写对不对？
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1楼 2014-05-18 10:51:21
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励应助！ 2014-05-18 21:03:17
smile901018: 金币+2 2014-05-21 08:47:48
因为你没有区分各段基因的起始位置。可以这么写，有几个序列我就是参考别人这么注释的。
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学习使你立于不败之地
2楼2014-05-18 11:13:22
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lepoly

捐助贵宾 (小有名气)
楼主你好，我想扩真菌的28s，应该选哪一对通用引物啊，求大侠指点！
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3楼2015-06-23 09:10:29
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smile901018

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lepoly at 2015-06-23 09:10:29
楼主你好，我想扩真菌的28s，应该选哪一对通用引物啊，求大侠指点！

应该ITS3-ITS4可以，仅供参考，可以去查查文献啊
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4楼2015-06-23 11:26:48
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lepoly

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by smile901018 at 2015-06-23 11:26:48
应该ITS3-ITS4可以，仅供参考，可以去查查文献啊...

嗯，好的，谢啦~~
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5楼2015-06-23 16:31:12
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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6楼2015-06-25 10:43:04
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
smile901018: 金币+3, ★★★★★最佳答案 2015-06-26 09:02:59
引用回帖:
6楼: Originally posted by xiadongliang at 2015-06-25 10:43:04
https://www.gfsstp.com/imgres?imgurl=http://www.phytophthoradb.org/img/ITS-NEW.PNG&imgrefurl=http://www.phytophthoradb.org/protocols.php&h=720&w=960&tbnid=66dP0s_t2lOwyM:&zoom=1&a ...

连接有可能打不开，图片如下。
NCBI真菌ITS序列上传问题
ITS-NEW.png
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7楼2015-06-25 10:46:02
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