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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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嘟嘟哒

金虫 (小有名气)

[求助] 一个表达方面的问题 已有2人参与

实验需要,自己设计合成了一段基因序列,其中一种密码子重复频率过高,现在表达没有结果,BL21的菌,pet28a质粒,IPTG浓度也从0.05试到了1还是没有表达,请问是因为同一个密码子使用次数过多导致的么?有没有什么解决办法?
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meng_xu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
嘟嘟哒(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-05-08 19:22:56
嘟嘟哒: 金币+5 2014-05-22 14:53:05
你的密码子是coli偏好的还是真核生物偏好的?如果是因为密码子偏好,可以尝试用BL21 Rosetta看看。

我最近也在用BL21表达,也有好多不表达的情况,也在一一尝试。
2楼2014-05-08 02:09:34
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嘟嘟哒

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by meng_xu at 2014-05-08 02:09:34
你的密码子是coli偏好的还是真核生物偏好的?如果是因为密码子偏好,可以尝试用BL21 Rosetta看看。

我最近也在用BL21表达,也有好多不表达的情况,也在一一尝试。

coli偏好,当初设计的时候考虑到GC含量,就忽略了这个问题,也可能是同一个密码子使用频率太高,我现在也在做rosetta
3楼2014-05-09 09:12:57
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ganchao1776

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-06-05 10:11:46
在rosetta里试的有结果了没有呀?
我觉的应该还是没有结果吧,你这是重复序列太多了,在转录过程出现了问题。
4楼2014-06-05 09:45:40
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2014-06-05 10:12:03
强烈建议重新设计
这种密码子重复率过高,不管是什么菌,合成都是个问题,所以最终会导致不够用,然后就不表达了。

其实细菌表达,密码子偏好性不需要考虑太多,因为本身细菌就是高表达。
天行健
5楼2014-06-05 10:06:48
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