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20130404

新虫 (初入文坛)

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[求助] gromacs模拟小分子

最近刚接触计算机模拟，用gromacs做一些简单的水分子模拟，在用SPC模型模拟时总会报错或者能量最小化不了，在模拟非刚性模型时就不会出现这个情况，所以想请教各位前辈，就是gromacs能模拟刚性模型的水分子吗？如果可以的话力场参数中要不要写上键伸缩常数和键角弯曲常数，因为我试过不写的话运行不了。但是写上的话我又觉得这变成了非刚性模型，希望大家给我答答疑，不吝赐教

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1楼2014-05-04 08:51:07

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2楼2014-05-04 08:53:27

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