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wardwaads

银虫 (小有名气)

[求助] 琼脂糖凝胶电泳:同一批样每次结果不一致,为什么?_? 已有2人参与

请大家帮我分析一下下面这三张图:
这三张图都是同一批PCR产物的,目的条带大小为400多bp,其中 图4.21 是pcr结束后立即跑的;图new1 图new2 分别是隔夜后第2,3次跑的。

我自己有以下几个疑惑:
1.图4.21 中为什么目的条带是月牙形的?胶上背景不均我认为可能和没有冲洗彻底有关,或者是制胶问题?
2.图new1 同一批样品为什么完全没有显示条带?marker是有的。
3.图new2 再次跑了之后发现又有了条带,但是参差不齐,而且大部分目的条带不在400bp了,不知道是为什么?
4.另外空白样中出现了目的条带,我不认为我操作中出现了交叉污染。可能是什么原因导致呢?


另外需要说明的是,我的这些条带是通过两步法PCR做出的。即:第一次PCR后取产物加入新的体系中进行第二次PCR,然后来跑胶。因为第一次PCR产物跑胶一直跑不出来,所以我认为是由于我的模板含量在我的样本中的含量过低。

请大家帮我分析分析,谢谢~

琼脂糖凝胶电泳:同一批样每次结果不一致,为什么?_?
new1.jpg


琼脂糖凝胶电泳:同一批样每次结果不一致,为什么?_?-1
new2.jpg


琼脂糖凝胶电泳:同一批样每次结果不一致,为什么?_?-2
4.21.jpg
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wardwaads

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 凌波丽 at 2014-04-27 10:07:56
PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致(作者:凌波丽)

2013年9月24日

    PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带与非特异性扩增带,其原因与对策如下:
I.引物与靶序 ...

谢谢你!
我的这个循环次数是比较多,经过了2次PCR,每次有35个循环。只是不知道这结果出现的条带位置不对的话,还是不是目的条带?还是出现了其他的非特异性扩增。这一点我准备拿去测序。

另外为什么同一批结果不同电泳成图都不一样呢,这一点我很奇怪。
7楼2014-04-28 09:40:13
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查看全部 11 个回答

yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
确定后目的条带位置?你的Marker没标错吧最低多少?
学习使你立于不败之地
2楼2014-04-24 10:44:00
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wardwaads

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuren2009 at 2014-04-24 10:44:00
确定后目的条带位置?你的Marker没标错吧最低多少?

DL500,分别是:500,400,300,200,150,100,50
3楼2014-04-25 09:49:20
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jonew

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
月牙形说明你胶浓度小   另外小孔胶有时候就这样
借口很贱,,,
4楼2014-04-25 10:20:52
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