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314243568

银虫 (小有名气)

[求助] 真菌基因敲出抗生素假阳性问题!

细菌,比如大肠杆菌,解淀粉芽孢杆菌等基因敲出很容易,而且用Amp等抗生素筛选标记出现的假阳性比例相当低。

但是,对于真菌来说,这个就是一个头疼的问题,比如烟曲霉,黑曲霉等菌株,用潮霉素做筛选标记,正常情况下无标记的菌株是不能在含有抗生素的平板上生长的,抗性标记的质粒线性化后电转原生质体后涂板筛选,按道理长出来应该基本上都是成功整合上基因组(不管整合正确与否),

问题就在于此,这一群筛选出来的转化子重新转接到含有潮霉素抗性的平板上基本上都能够很好的生长(有对照,对照不长),这也就证明了其导入了潮霉素抗性基因,但是PCR验证结果显示全部error,基因组中无潮霉素基因片段。

这一情况我一直想不通,难道和潮霉素抗性机理相关?但是在黑曲霉中,我们也用了营养缺陷型菌株,结果相同。不知道同行们有什么能够建议的,还望不吝赐教!
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Nothingcannotbedone!
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314243568

银虫 (小有名气)

1
2楼2014-08-01 11:26:05
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jdhdragon

新虫 (初入文坛)

我也发现这个问题,很多潮霉素抗性菌株pcr检测都没有目标基因在里面
3楼2014-08-01 16:58:03
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314243568

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jdhdragon at 2014-08-01 16:58:03
我也发现这个问题,很多潮霉素抗性菌株pcr检测都没有目标基因在里面

那请问你最后解决了这个问题了吗?
Nothingcannotbedone!
4楼2014-08-05 15:20:42
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zbl217

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 314243568 at 2014-08-05 15:20:42
那请问你最后解决了这个问题了吗?...

你用电击法转化成功了没?我一直没做出来,想请教请教,谢谢了
5楼2015-05-20 20:02:35
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yxx20060429

新虫 (小有名气)

楼主有解淀粉芽孢杆菌的转化方法吗?我做的一直假阳性。真菌删除可以采用分割标记法,3次同源重组,想出来的基本是真的

发自小木虫IOS客户端
6楼2017-10-19 10:18:42
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晚歌Shirley

新虫 (初入文坛)

最近做黑曲霉的潮霉素筛选,也是存在在潮霉素抗性板上生长,但是鉴定没有目标基因, 不知道问题出在哪里,原始菌在这个浓度下已经不生长,转化后的转化子生长,但是没有潮霉素基因。不知道问题出在哪里,有没有大神可以解答
7楼2017-11-21 18:40:01
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前行的璐

新虫 (小有名气)

虫友们,有做过乙酰胺(amdS)为筛选标记的吗。不太了解,有没有相关的文献可以参考
8楼2018-01-23 15:14:07
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burma9

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 晚歌Shirley at 2017-11-21 18:40:01
最近做黑曲霉的潮霉素筛选,也是存在在潮霉素抗性板上生长,但是鉴定没有目标基因, 不知道问题出在哪里,原始菌在这个浓度下已经不生长,转化后的转化子生长,但是没有潮霉素基因。不知道问题出在哪里,有没有大神 ...

你好,我最近也是用潮霉素筛选出现假阳性,请问你解决了吗?实验做的好艰难啊

发自小木虫IOS客户端
9楼2018-09-12 00:58:02
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