| 查看: 926 | 回复: 4 | ||
keke_1210木虫 (小有名气)
|
[求助]
Autodock三体对接
|
|
我现在做的是蛋白酶抑制剂的动力学模拟研究。抑制剂与该酶的辅酶因子竞争性结合该酶。现在已经做了抑制剂与该酶的分子动力学模拟，知道其机理，想进一步确定下辅酶因子的非竞争性结合的作用能，与抑制剂进行比较。 想将辅酶因子对接到抑制剂与该酶的复合物，然后进行一段时间的MD，这个是做半柔性对接好呢，还是刚性对接好呢？半柔性对接的话需要限制哪些键或残基不旋转？这个半柔性对接对于辅酶因子不知道符不符合生物上的机理？ 现在用的对接软件是AUTODOCK4.0，有没有更好地建议？ |
回复此楼» 猜你喜欢
国自然评审意见
已经有16人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有7人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有18人回复
-
2026年叶企孙基金
已经有7人回复
-
我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？
已经有6人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有13人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有14人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- autodock对接的氢键
已经有7人回复
- Autodock的dlg文件有没有好的分析软件，一个一个另存导入到Pymol太慢了
已经有3人回复
- autodock柔性对接
已经有5人回复
- Autodock对接构象准确性的评价——RMSD
已经有10人回复
- 用autodock对接，用什么软件定点突变蛋白质
已经有14人回复
- linux下的autodock在run autodock时不出现dlg文件
已经有8人回复
- autodock对接时蛋白的处理问题
已经有6人回复
- Autodock中受体的准备
已经有14人回复
- 有关Autodock结果分析中结合自由能的问题
已经有6人回复
- autodock的安装
已经有10人回复
- 用autodock做对接，box设置无法包括受体活性区域和配体
已经有6人回复
- AUTODOCK对接步骤求助(附图）
已经有7人回复
- 用AutoDock作分子对接前的小分子能量最小化问题
已经有6人回复
- AutoDock的安装？
已经有7人回复
- Autodock对接构象有问题，请教
已经有7人回复
- 【求助】请教Autodock结果分析
已经有8人回复
- 【求助】autodock4 安装问题
已经有9人回复
- 【求助】高手求助,Autodock4 最后一步无法对接,弄了几天!
已经有7人回复
- 【求助】求助：怎样将Autodock做出来的对接图保存成pdb格式？谢谢
已经有12人回复
- 【原创】AutoDock使用笔记总结－原创始发
已经有32人回复
keke_1210
木虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3050.7
- 红花: 1
- 帖子: 122
- 在线: 123.7小时
- 虫号: 1999637
- 注册: 2012-09-14
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
2楼2014-04-14 17:15:09
老曼7
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 5876.9
- 散金: 227
- 红花: 4
- 帖子: 506
- 在线: 109.5小时
- 虫号: 1941783
- 注册: 2012-08-16
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
3楼2016-01-29 14:56:52
keke_1210
木虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3050.7
- 红花: 1
- 帖子: 122
- 在线: 123.7小时
- 虫号: 1999637
- 注册: 2012-09-14
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
4楼2016-01-29 15:35:35
老曼7
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 5876.9
- 散金: 227
- 红花: 4
- 帖子: 506
- 在线: 109.5小时
- 虫号: 1941783
- 注册: 2012-08-16
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
5楼2016-01-29 19:24:19
30