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分子动力学问题
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我是分子动力学的菜鸟，两个问题请教下。 一，我做的石英和白云母的动力学模拟，首先对这两个晶体进行切面后优化表面，用的是一篇国外论文的方法，是用Forcite模块，NPT，300K，步数为500ps。结果模拟出来之后的晶体结构好像没有很大变化，但是晶体外面的晶格线上移了一段，不知道怎么解释。 二，我做石英（羟基化）和油酸钠的吸附动力学模拟后，发现油酸钠被排斥到真空层间，但是计算的吸附能又为正值，真的不知道怎么回事，难道是我的力场用得不对，但是计算其他的药剂都还好。 |
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