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liliinjn

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[求助] 蛋白序列确定已有1人参与

请教大家几个问题，我做活性蛋白质的分离纯化，后期得到的蛋白进行二级质谱测序，从数据库中匹配得到可能的蛋白序列，与我要得到的目的蛋白具有相似性但是没有该活性的报道，我是可以直接认为该蛋白就是我的目的蛋白只不过是它同时具有两种活性，还是应该买来这种蛋白鉴定一下有没有我要的活性，还是应该拿我的蛋白来做一下有没有已报道的这种活性？

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1楼 2014-04-09 20:05:35

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liyaid

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引用回帖:

3楼: Originally posted by liliinjn at 2014-09-03 11:07:49
做的二级质谱鉴定测序没成功与匹配蛋白相似度99+% 与匹配蛋白序列比较除了少一个信号肽序列基本相同
你的意思是用我的蛋白去做一下有没有已报道的活性如果有就可以认为是该蛋白同时具有两种活性
那如果没有呢 ...

如果没有，那就没有，你的蛋白质会不会是匹配蛋白的一个亚基呢？你的蛋白分子量与匹配蛋白一样吗？如果不一样，考虑是否为其中一个亚基，如果不是，那么你的和匹配蛋白就不是一种蛋白