应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 怎么计算蛋白的等电点，谢谢
151/2返回列表12下一页
查看: 2015  |  回复: 14
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

475502411

铜虫 (著名写手)

[求助] 怎么计算蛋白的等电点，谢谢

我是用一个软件计算蛋白的等电点，但是突然想到在目的蛋白的前后还有一些片段也会翻译成蛋白，所以计算等电点时除了考虑标签的影响，要不要把载体上，目的片段前后的一些序列也翻译成蛋白啊？

敬请高手指点
谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
可以朝九晚五，也能浪迹天涯
1楼2012-08-20 17:50:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

生物-TJAB

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-08-22 15:03:35
软件也是不十分可靠的！你可以根据软件所得到的值分别过阴阳离子柱来进一步的确定啊！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2012-08-20 23:56:12
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

河外生命

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
当然要包括翻译出来的所有的氨基酸了，只要没被蛋白酶切掉。
赞一下(1人) 回复此楼
事在人为
3楼2012-08-20 23:59:19
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tanglian8655

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
从相应的起始位置开始计算
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2012-08-21 08:48:52
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

河外生命

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-08-22 15:03:58
引用回帖:
5楼: Originally posted by 475502411 at 2012-08-21 13:06:38
就是说的从起始密码子到终止密码子全翻译出来看等电点？还是我在软件里直接输入目的蛋白，加上所带标签啊？谢谢...

大肠杆菌表达就从起始到终止密码子，这段序列才是你真正拿到手的蛋白序列。如果是用酵母表达，情况要复杂些，它表达出来有时会经过蛋白酶加工，会将N端切掉一段，需要考虑水解的情况。
赞一下(1人) 回复此楼
事在人为
8楼2012-08-21 21:06:06
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

河外生命

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
475502411: 金币+2 2012-08-27 18:45:55
如果连在载体的起始序列后，当然从载体序列算起；如果载体的序列切掉了，从你的蛋白的序列开始翻译，当然只算你的蛋白就可以了。
赞一下(1人) 回复此楼
事在人为
10楼2012-08-22 20:01:12
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jl860822

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你说的这几个载体网上都有公布序列吧
查一下看看吧
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2012-08-23 08:36:25
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枫叶留殇

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可搜索一下Expasy,里面有等电点的估算，还有ＤＮＡ的翻译
赞一下(1人) 回复此楼
在冲往未来的道路上，我会全力以赴~~~
12楼2012-08-23 15:25:41
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)
★ ★ ★
475502411: 金币+3 2012-08-27 18:45:07
本帖仅楼主可见
赞一下
13楼2012-08-23 18:21:12
 已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

生物-TJAB

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-08-24 13:50:21
引用回帖:
6楼: Originally posted by 475502411 at 2012-08-21 13:08:06
这样啊，但是我的载体PET-TRX、PET-DSbA、PET-His我没有他们的全序列，测序也只是一部分，我怎么计算啊？
谢谢...

那就用软件吧！除了标签和目的蛋白应该没多少额外的氨基酸吧！额外的应该影响不大，就直接输入标签加目的蛋白就行了！再说软件就是估算啊！做多了就不会纠结这些了！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下(1人) 回复此楼
14楼2012-08-24 10:04:27
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

475502411

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 河外生命 at 2012-08-20 23:59:19
当然要包括翻译出来的所有的氨基酸了，只要没被蛋白酶切掉。

就是说的从起始密码子到终止密码子全翻译出来看等电点？还是我在软件里直接输入目的蛋白，加上所带标签啊？谢谢
赞一下 回复此楼
可以朝九晚五，也能浪迹天涯
5楼2012-08-21 13:06:38
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

475502411

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by tanglian8655 at 2012-08-21 08:48:52
从相应的起始位置开始计算

这样啊，但是我的载体PET-TRX、PET-DSbA、PET-His我没有他们的全序列，测序也只是一部分，我怎么计算啊？
谢谢
赞一下 回复此楼
可以朝九晚五，也能浪迹天涯
6楼2012-08-21 13:08:06
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

475502411

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 生物-TJAB at 2012-08-20 23:56:12
软件也是不十分可靠的！你可以根据软件所得到的值分别过阴阳离子柱来进一步的确定啊！

这样啊，但是听起来好麻烦啊，我现在把一个目的片段谅解了5个载体，这样挺浪费时间的，我只是想大概看一下。
赞一下 回复此楼
可以朝九晚五，也能浪迹天涯
7楼2012-08-21 13:09:26
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

475502411

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 河外生命 at 2012-08-21 21:06:06
大肠杆菌表达就从起始到终止密码子，这段序列才是你真正拿到手的蛋白序列。如果是用酵母表达，情况要复杂些，它表达出来有时会经过蛋白酶加工，会将N端切掉一段，需要考虑水解的情况。...

您好，我出初做，了解的很少。请问我序列本身有起始密码子，但是载体本身也有，我就不知道应该从我的起始密码子算起还是冲启动子的位置算起，看蛋白的等电点和疏水性？谢谢
赞一下 回复此楼
可以朝九晚五，也能浪迹天涯
9楼2012-08-22 16:06:08
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 475502411 的主题更新
151/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭