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liuliancy

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 离子交换层析(deae-纤维素)出峰差异很大(有图谱)

昨天用DEAE-纤维素过柱子,图谱如1,目标蛋白跟杂蛋白差没分开,今天用相同的缓冲液相同的上样量和样品,结果却一点都没分开,柱子1*20,上样2ml,梯度洗脱液为50mL 20mmo/L pH7.5 Tris一乙酸缓冲液和50ml 50mmol/L pH5.0Tris一乙酸缓冲液(含0.3mol/L 氯化钠),得到的图谱却是2和3的样子,请教各位长辈这是为什么?洗脱液要怎么调节才能将得到较好的洗脱效果?
                             图1

                                                  图2

                                                  图3


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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

★ ★
adslye(金币+2, BioEPI+1): 鼓励经典~祝顺利! 2011-08-18 09:20:19
liuliancy(金币+3): 感谢老大!!! 2011-08-18 09:27:20
1、我没听说过Tris-醋酸这个缓冲液,你有没有试过Tris-盐酸缓冲液?

2、你的两个洗脱液用的是20mmo/L pH7.5 Tris一乙酸缓冲液和50ml 50mmol/L pH5.0Tris一乙酸缓冲液(含0.3mol/L 氯化钠),看来你是想用pH梯度和离子强度一起来制造一个洗脱梯度,这样做有什么依据吗?我认为这样会引入误差,因为两个因素制造的梯度可控制性可能会弱于一个因素。如果用pH值,不知道稍低的pH值会不会引起蛋白质失活,所以我喜欢用离子强度作为洗脱梯度,起始缓冲液和洗脱缓冲液的pH值相同,但是氯化钠分别为0和1M,能制作出一条从0-1M的连续线性梯度。这样结果也更好分析。

3、两个峰即使是顶点能分开,但交叉很大也是不纯的。DEAE在我的实验里分离效果差,比不上其它的阴离子交换层析柱,如果有别的层析柱,也可以联用。

4、层析柱1*20没有意义,计算柱体积才有意义。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
2楼2011-08-18 00:06:28
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liuliancy

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-08-18 00:06:28:
1、我没听说过Tris-醋酸这个缓冲液,你有没有试过Tris-盐酸缓冲液?

2、你的两个洗脱液用的是20mmo/L pH7.5 Tris一乙酸缓冲液和50ml 50mmol/L pH5.0Tris一乙酸缓冲液(含0.3mol/L 氯化钠),看来你是想用pH梯度和 ...

感谢老大了!!不过Tris-醋酸我也是第一次听说,一个文献上的洗脱条件,这些东西也都是第一次用所有很多不太了解,用Tris-Hcl氯化钠分别为0和1M梯度试试,不知道老大能不能推荐几个阴离子交换层析柱,我做的是SOD(超氧化物歧化酶),再次感谢!!
3楼2011-08-18 09:35:05
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alexlv

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


liuliancy(金币+1): 不要盯着一个柱子?难道要几个一起? 2011-08-18 13:16:05
adslye(金币+1): 感谢交流~祝顺利! 2011-08-18 19:22:52
控制好洗脱梯度和体积,以及PH,当然不要盯着一个柱子。
4楼2011-08-18 12:06:14
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

你方不方便先试一下我说的条件,大概会花一天,再把结果发上来。
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5楼2011-08-19 00:47:10
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btx362237729

金虫 (正式写手)

这个要学习一下
人生最黑暗的时光终于过去了
6楼2011-08-19 12:17:49
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liuliancy

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-08-19 00:47:10:
你方不方便先试一下我说的条件,大概会花一天,再把结果发上来。

做了下,分别用20mM tris-乙酸ph7.5和50mM tris-乙酸ph5.0(含NaCl 0.3M)、20mM tris-hcl ph7.5和20mM tris-hcl ph7.5(含NaCl 1M)、20mM tris-hcl ph7.8和20mM tris-hcl ph7.8(含NaCl 0.8M)、20mM tris-hcl ph7.2和20mM tris-hcl ph7.2(含NaCl 0.8M)图谱如下:
20mM tris-乙酸ph7.5和50mM tris-乙酸ph5.0(含NaCl 0.3M)

20mM tris-hcl ph7.5和20mM tris-hcl ph7.5(含NaCl 1M)

20mM tris-hcl ph7.8和20mM tris-hcl ph7.8(含NaCl 0.8M)

20mM tris-hcl ph7.2和20mM tris-hcl ph7.2(含NaCl 0.8M)


请指教!
7楼2011-08-19 20:32:19
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

做得很好,我有两个问题:酶活力在哪里;横轴的0是不是开始进入0-100%洗脱梯度,是不是不包括上样和平衡,如果包括,那么洗脱时间是从哪里到哪里?
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
8楼2011-08-19 21:32:30
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liuliancy

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-08-19 21:32:30:
做得很好,我有两个问题:酶活力在哪里;横轴的0是不是开始进入0-100%洗脱梯度,是不是不包括上样和平衡,如果包括,那么洗脱时间是从哪里到哪里?

酶活都是第三个峰,前面的两个都是杂质;横轴的0就是直接上好样后进入0-100%梯度洗脱的,把平衡的也算在内了,也就是加样后没平衡直接梯度的,这样不行吗?
9楼2011-08-19 21:55:34
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xiehe_ai

金虫 (著名写手)

我最近也遇到一个问题,改天我也把图截过来,大家帮我分析分析是怎么回事
夫天地者,万物之逆旅也;光阴者,百代之过客也。而浮生若梦,为欢几何?古人秉烛夜游,良有以也。况阳春召我以烟景,大块假我以文章。
10楼2011-08-20 00:21:13
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