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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 蛋白序列确定
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liliinjn

金虫 (小有名气)

[求助] 蛋白序列确定 已有1人参与

请教大家几个问题，我做活性蛋白质的分离纯化，后期得到的蛋白进行二级质谱测序，从数据库中匹配得到可能的蛋白序列，与我要得到的目的蛋白具有相似性但是没有该活性的报道，我是可以直接认为该蛋白就是我的目的蛋白只不过是它同时具有两种活性，还是应该买来这种蛋白鉴定一下有没有我要的活性，还是应该拿我的蛋白来做一下有没有已报道的这种活性？
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1楼 2014-04-09 20:05:35
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liyaid

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
liliinjn: 金币+10, 做的二级质谱鉴定 测序没成功 与匹配蛋白相似度99+% 与匹配蛋白序列比较除了少一个信号肽序列基本相同 2014-09-03 11:06:45
你做的是二级质谱鉴定还是直接测序？得到多少个氨基酸序列？与匹配蛋白的相似度是多少？我觉得应该拿你的蛋白质做一下有没有其他生物活性，直接买匹配蛋白质也不一定就能说明问题。。。。。
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加油
2楼2014-08-31 20:39:38
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liliinjn

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liyaid at 2014-08-31 20:39:38
你做的是二级质谱鉴定还是直接测序？得到多少个氨基酸序列？与匹配蛋白的相似度是多少？我觉得应该拿你的蛋白质做一下有没有其他生物活性，直接买匹配蛋白质也不一定就能说明问题。。。。。

做的二级质谱鉴定 测序没成功 与匹配蛋白相似度99+% 与匹配蛋白序列比较除了少一个信号肽序列基本相同
你的意思是用我的蛋白去做一下有没有已报道的活性 如果有就可以认为是该蛋白同时具有两种活性
那如果没有呢？该怎么办？
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3楼2014-09-03 11:07:49
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liyaid

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by liliinjn at 2014-09-03 11:07:49
做的二级质谱鉴定 测序没成功 与匹配蛋白相似度99+% 与匹配蛋白序列比较除了少一个信号肽序列基本相同
你的意思是用我的蛋白去做一下有没有已报道的活性 如果有就可以认为是该蛋白同时具有两种活性
那如果没有呢 ...

如果没有，那就没有，你的蛋白质会不会是匹配蛋白的一个亚基呢？你的蛋白分子量与匹配蛋白一样吗？如果不一样，考虑是否为其中一个亚基，如果不是，那么你的和匹配蛋白就不是一种蛋白
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加油
4楼2014-09-04 09:29:03
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liliinjn

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liyaid at 2014-09-04 09:29:03
如果没有，那就没有，你的蛋白质会不会是匹配蛋白的一个亚基呢？你的蛋白分子量与匹配蛋白一样吗？如果不一样，考虑是否为其中一个亚基，如果不是，那么你的和匹配蛋白就不是一种蛋白...

就目前来看，与匹配蛋白脱掉信号肽后序列的分子量是相同的
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5楼2014-09-09 10:50:18
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