24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2935  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cyta201

新虫 (初入文坛)

[求助] mega做出来的系统发育树如下,求助是什么问题 已有2人参与

先声明本人是maga新手用户- -,公司测序回来的结果先在NCBI上比对了,然后选了几种相似度比较大的菌株,把序列下下来在mega上做比对,结果如下,mega软件是按照下面的教程用的,求指教~mega做出来的系统发育树如下,求助是什么问题
系统发育树.jpg
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : MEGA软件——系统发育树构建方法.pdf
  • 2014-03-17 20:46:35, 1.74 M

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

crydevil

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
dllchina: 金币+1, 谢谢应助 2014-03-20 16:33:42
cyta201: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-03-22 18:25:45
建议建树的时候 至少找个外群吧,再把50以下的分支合并处理
6楼2014-03-20 14:20:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cyta201: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2014-03-22 18:25:31
确实是新手,是mega,不是maga,一般稳定的进化树用的是16S全长来构建的,你这置信值太低了,建议调取临近属的序列再画,芽孢杆菌属属调取相似度最高的即可
2楼2014-03-17 23:19:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cyta201

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dllchina at 2014-03-17 23:19:28
确实是新手,是mega,不是maga,一般稳定的进化树用的是16S全长来构建的,你这置信值太低了,建议调取临近属的序列再画,芽孢杆菌属属调取相似度最高的即可

谢谢dllchina的回复,maga是打错了,囧,从来没做过这个,同实验室的也没有会做的,公司测序回来的只有2700左右的碱基没有全长,和临近属的比对?和芽孢乳杆菌属、梭菌属、脱硫肠状菌属比对?
3楼2014-03-18 16:39:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

引用回帖:
3楼: Originally posted by cyta201 at 2014-03-18 16:39:17
谢谢dllchina的回复,maga是打错了,囧,从来没做过这个,同实验室的也没有会做的,公司测序回来的只有2700左右的碱基没有全长,和临近属的比对?和芽孢乳杆菌属、梭菌属、脱硫肠状菌属比对?...

2700bp,你是测的什么啊,不是16S么?细菌16S全长也就1500多啊。。。我刚发布了一个画树的帖子,你去瞅瞅吧
4楼2014-03-18 20:19:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 化学070300 求调剂 +29 哈哈哈^_^ 2026-04-12 29/1450 2026-04-18 15:56 by Equinoxhua
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 0854求调剂 +21 门路摸摸 2026-04-15 25/1250 2026-04-17 15:45 by qzxyhcsy
[考研] 一志愿沪9,326求生物学调剂 +11 刘墨墨 2026-04-13 11/550 2026-04-17 15:35 by wanganpin
[考研] 恳请有学校收留 +8 柯淮然 2026-04-12 8/400 2026-04-17 09:34 by 猪会飞
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[考博] 申博自荐 +3 Linxia林夏 2026-04-13 3/150 2026-04-16 12:55 by 墨荷之露
[考研] 药学求调剂 +14 喽哈加油 2026-04-14 16/800 2026-04-16 10:15 by beilsong20
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+7 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 29/1450 2026-04-16 09:00 by screening
[考研] 085404 22408 309分求调剂 +9 lzmk 2026-04-14 10/500 2026-04-15 20:02 by 学员JpLReM
[考研] 生物学调剂 +9 纸扇zhishan 2026-04-13 9/450 2026-04-15 18:28 by AN流800
[考研] 0854调剂 +13 长弓傲 2026-04-12 16/800 2026-04-15 13:45 by fenglj492
[考研] 考研求调剂 +6 ban班小七 2026-04-11 6/300 2026-04-14 14:06 by 哆啦A梦只是个梦
[考研] 食品与营养(0955)271求调剂 +15 升格阿达 2026-04-12 16/800 2026-04-14 13:18 by 浮若_安生
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +24 叶zilin 2026-04-13 25/1250 2026-04-14 09:20 by 试管破裂
[考研] B区0809 ,数一英一,290 求调剂 +3 泠潍1111 2026-04-12 4/200 2026-04-13 20:35 by 学员JpLReM
[考研] 339求调剂 +4 hanwudada 2026-04-12 4/200 2026-04-13 12:03 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿085802 323分求调剂 +13 drizzle_9 2026-04-12 14/700 2026-04-13 10:26 by Faiz5552
[考研] 一志愿浙大生物325分求调剂 +9 zysheng 2026-04-12 9/450 2026-04-12 22:31 by yuyin1233
信息提示
请填处理意见