24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2913  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cyta201

新虫 (初入文坛)

[求助] mega做出来的系统发育树如下,求助是什么问题 已有2人参与

先声明本人是maga新手用户- -,公司测序回来的结果先在NCBI上比对了,然后选了几种相似度比较大的菌株,把序列下下来在mega上做比对,结果如下,mega软件是按照下面的教程用的,求指教~mega做出来的系统发育树如下,求助是什么问题
系统发育树.jpg
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : MEGA软件——系统发育树构建方法.pdf
  • 2014-03-17 20:46:35, 1.74 M

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cyta201

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dllchina at 2014-03-17 23:19:28
确实是新手,是mega,不是maga,一般稳定的进化树用的是16S全长来构建的,你这置信值太低了,建议调取临近属的序列再画,芽孢杆菌属属调取相似度最高的即可

谢谢dllchina的回复,maga是打错了,囧,从来没做过这个,同实验室的也没有会做的,公司测序回来的只有2700左右的碱基没有全长,和临近属的比对?和芽孢乳杆菌属、梭菌属、脱硫肠状菌属比对?
3楼2014-03-18 16:39:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cyta201: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2014-03-22 18:25:31
确实是新手,是mega,不是maga,一般稳定的进化树用的是16S全长来构建的,你这置信值太低了,建议调取临近属的序列再画,芽孢杆菌属属调取相似度最高的即可
2楼2014-03-17 23:19:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

引用回帖:
3楼: Originally posted by cyta201 at 2014-03-18 16:39:17
谢谢dllchina的回复,maga是打错了,囧,从来没做过这个,同实验室的也没有会做的,公司测序回来的只有2700左右的碱基没有全长,和临近属的比对?和芽孢乳杆菌属、梭菌属、脱硫肠状菌属比对?...

2700bp,你是测的什么啊,不是16S么?细菌16S全长也就1500多啊。。。我刚发布了一个画树的帖子,你去瞅瞅吧
4楼2014-03-18 20:19:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cyta201

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dllchina at 2014-03-18 20:19:46
2700bp,你是测的什么啊,不是16S么?细菌16S全长也就1500多啊。。。我刚发布了一个画树的帖子,你去瞅瞅吧...

是1400多个,被这东西搞的混乱了,分子知识需要补补额,谢谢
5楼2014-03-20 13:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 药学305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-10 8/400 2026-04-12 00:07 by zhouwenxian
[考研] 求助调剂,跨调 +11 X十甫寸Y 2026-04-11 11/550 2026-04-11 23:49 by 学zh
[考研] 0854调剂 +11 长弓傲 2026-04-09 12/600 2026-04-11 11:16 by zhq0425
[考研] 085500求调剂材料 +10 易11122 2026-04-09 10/500 2026-04-11 10:39 by maddjdld
[考研] 农学0904 312求调剂 +6 Say Never 2026-04-10 6/300 2026-04-11 10:33 by wwj2530616
[考研] 工科273调剂 +6 X1999 2026-04-09 7/350 2026-04-11 10:23 by zhq0425
[考研] 275求调剂 +9 1624447980 2026-04-08 10/500 2026-04-11 10:20 by Delta2012
[考研] 本科211 工科085400 280分求调剂 可跨专业 +11 LZH(等待调剂中 2026-04-10 11/550 2026-04-11 08:39 by zhq0425
[考研] 一志愿中南大学物理学,英一66,求调剂 +4 长烟旖旎 2026-04-08 5/250 2026-04-10 10:31 by 颖果儿
[考研] 青岛科技大学材料学院,环境学院调剂补录4月10日以前都可以 +3 1青科大。 2026-04-09 5/250 2026-04-10 09:58 by 翩翩一书生
[考研] 一志愿 江南大学 085602 化工专硕 338分求调剂 +16 路痴小琪 2026-04-05 16/800 2026-04-10 08:08 by kangsm
[考研] 367求调剂 +10 hffQAQ 2026-04-09 10/500 2026-04-09 18:06 by lijunpoly
[考研] 348求调剂 +3 candyyyi 2026-04-09 3/150 2026-04-09 17:20 by 段伟艳
[考研] 考研调剂 +13 冰冰,,, 2026-04-07 13/650 2026-04-09 17:01 by Lilly_Li
[考研] 318求调剂 +13 ykyhsa 2026-04-05 15/750 2026-04-08 21:37 by wj165256
[考研] 293分求调剂,外语为俄语 +7 加一一九 2026-04-07 10/500 2026-04-08 20:14 by yutian743
[考研] 一志愿西南090202求调剂 +4 在线求有学上 2026-04-07 4/200 2026-04-07 19:47 by biomichael
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358求调剂 +10 cs0106 2026-04-05 12/600 2026-04-06 19:41 by 无际的草原
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 20:07 by 啵啵啵0119
[考研] 315求调剂 +5 &123456789 2026-04-05 5/250 2026-04-05 19:55 by nepu_uu
信息提示
请填处理意见