24小时热门版块排行榜    

查看: 2854  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cyta201

新虫 (初入文坛)

[求助] mega做出来的系统发育树如下,求助是什么问题 已有2人参与

先声明本人是maga新手用户- -,公司测序回来的结果先在NCBI上比对了,然后选了几种相似度比较大的菌株,把序列下下来在mega上做比对,结果如下,mega软件是按照下面的教程用的,求指教~mega做出来的系统发育树如下,求助是什么问题
系统发育树.jpg
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : MEGA软件——系统发育树构建方法.pdf
  • 2014-03-17 20:46:35, 1.74 M

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cyta201

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dllchina at 2014-03-18 20:19:46
2700bp,你是测的什么啊,不是16S么?细菌16S全长也就1500多啊。。。我刚发布了一个画树的帖子,你去瞅瞅吧...

是1400多个,被这东西搞的混乱了,分子知识需要补补额,谢谢
5楼2014-03-20 13:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cyta201: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2014-03-22 18:25:31
确实是新手,是mega,不是maga,一般稳定的进化树用的是16S全长来构建的,你这置信值太低了,建议调取临近属的序列再画,芽孢杆菌属属调取相似度最高的即可
2楼2014-03-17 23:19:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cyta201

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dllchina at 2014-03-17 23:19:28
确实是新手,是mega,不是maga,一般稳定的进化树用的是16S全长来构建的,你这置信值太低了,建议调取临近属的序列再画,芽孢杆菌属属调取相似度最高的即可

谢谢dllchina的回复,maga是打错了,囧,从来没做过这个,同实验室的也没有会做的,公司测序回来的只有2700左右的碱基没有全长,和临近属的比对?和芽孢乳杆菌属、梭菌属、脱硫肠状菌属比对?
3楼2014-03-18 16:39:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

引用回帖:
3楼: Originally posted by cyta201 at 2014-03-18 16:39:17
谢谢dllchina的回复,maga是打错了,囧,从来没做过这个,同实验室的也没有会做的,公司测序回来的只有2700左右的碱基没有全长,和临近属的比对?和芽孢乳杆菌属、梭菌属、脱硫肠状菌属比对?...

2700bp,你是测的什么啊,不是16S么?细菌16S全长也就1500多啊。。。我刚发布了一个画树的帖子,你去瞅瞅吧
4楼2014-03-18 20:19:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 12/600 2026-03-01 19:48 by 好好好1233
[考研] 化工299分求调剂 一志愿985落榜 +5 嘻嘻(*^ω^*) 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:47 by 无际的草原
[考研] 材料学硕318求调剂 +9 February_Feb 2026-03-01 11/550 2026-03-01 19:47 by 无懈可击111
[考研] 0856材料求调剂 +11 hyf hyf hyf 2026-02-28 12/600 2026-03-01 18:57 by 18137688336
[考研] 化工专硕348,一志愿985求调剂 +5 弗格个 2026-02-28 8/400 2026-03-01 17:25 by sunny81
[考研] 281求调剂 +4 2026计算机_诚心 2026-03-01 7/350 2026-03-01 17:20 by 2026计算机_诚心
[考研] 0856材料求调剂 +4 麻辣鱿鱼 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:51 by caszguilin
[考研] 化工专硕342,一志愿大连理工大学,求调剂 +3 kyf化工 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:49 by yywzz
[考研] 0856调剂 +4 刘梦微 2026-02-28 4/200 2026-03-01 15:35 by 吸一口猫气
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-02-28 7/350 2026-03-01 15:14 by wjLi2017
[考研] 材料工程274求调剂 +3 Lilithan 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:58 by ms629
[考研] 求调剂 +6 repeatt?t 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:37 by Sakura绘
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 284求调剂 +6 天下熯 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:19 by Ducount.Y
[考研] 调剂 +3 简木ChuFront 2026-02-28 3/150 2026-03-01 11:46 by 王伟要上岸啊
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +6 Soliloquy_Q 2026-02-28 11/550 2026-03-01 11:14 by 歌liekkas
[考研] 寻找调剂 +4 LYidhsjabdj 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:56 by sunny81
[考研] 材料调剂 +4 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 4/200 2026-03-01 00:38 by 猫猫球alter
[考研] 264求调剂 +3 巴拉巴拉根556 2026-02-28 3/150 2026-02-28 21:31 by gaoxiaoniuma
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
信息提示
请填处理意见