24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2912  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cyta201

新虫 (初入文坛)

[求助] mega做出来的系统发育树如下,求助是什么问题 已有2人参与

先声明本人是maga新手用户- -,公司测序回来的结果先在NCBI上比对了,然后选了几种相似度比较大的菌株,把序列下下来在mega上做比对,结果如下,mega软件是按照下面的教程用的,求指教~mega做出来的系统发育树如下,求助是什么问题
系统发育树.jpg
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : MEGA软件——系统发育树构建方法.pdf
  • 2014-03-17 20:46:35, 1.74 M

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

引用回帖:
3楼: Originally posted by cyta201 at 2014-03-18 16:39:17
谢谢dllchina的回复,maga是打错了,囧,从来没做过这个,同实验室的也没有会做的,公司测序回来的只有2700左右的碱基没有全长,和临近属的比对?和芽孢乳杆菌属、梭菌属、脱硫肠状菌属比对?...

2700bp,你是测的什么啊,不是16S么?细菌16S全长也就1500多啊。。。我刚发布了一个画树的帖子,你去瞅瞅吧
4楼2014-03-18 20:19:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cyta201: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2014-03-22 18:25:31
确实是新手,是mega,不是maga,一般稳定的进化树用的是16S全长来构建的,你这置信值太低了,建议调取临近属的序列再画,芽孢杆菌属属调取相似度最高的即可
2楼2014-03-17 23:19:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cyta201

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dllchina at 2014-03-17 23:19:28
确实是新手,是mega,不是maga,一般稳定的进化树用的是16S全长来构建的,你这置信值太低了,建议调取临近属的序列再画,芽孢杆菌属属调取相似度最高的即可

谢谢dllchina的回复,maga是打错了,囧,从来没做过这个,同实验室的也没有会做的,公司测序回来的只有2700左右的碱基没有全长,和临近属的比对?和芽孢乳杆菌属、梭菌属、脱硫肠状菌属比对?
3楼2014-03-18 16:39:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cyta201

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dllchina at 2014-03-18 20:19:46
2700bp,你是测的什么啊,不是16S么?细菌16S全长也就1500多啊。。。我刚发布了一个画树的帖子,你去瞅瞅吧...

是1400多个,被这东西搞的混乱了,分子知识需要补补额,谢谢
5楼2014-03-20 13:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料考研调剂 +24 云木达达 2026-04-11 26/1300 2026-04-12 00:23 by 蓝云思雨
[考研] 339求调剂 +7 hanwudada 2026-04-11 7/350 2026-04-11 23:06 by 852137818
[考研] 085404 293求调剂 +9 勇远库爱314 2026-04-06 10/500 2026-04-11 10:36 by 紫曦紫棋
[考研] 293求调剂 +6 勇远库爱314 2026-04-08 6/300 2026-04-11 10:08 by zhq0425
[考研] 材料085601调剂 +25 何润采123 2026-04-10 27/1350 2026-04-10 23:17 by Ftglcn90
[基金申请] 有爆料,一个青年教师卖房得400万,然后换了一个四青帽子 +9 babu2015 2026-04-08 9/450 2026-04-10 11:43 by 苏东坡二世
[考研] 0702物理学学硕299求调剂 +6 祁柒连 2026-04-06 6/300 2026-04-10 11:10 by Roomoo
[考研] 调剂申请086000一志愿西北农林科技大学生物与医药320分-本科齐鲁工业大学 +3 美美女士 2026-04-09 3/150 2026-04-10 10:31 by liuhuiying09
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-04-05 11/550 2026-04-10 09:32 by 钟洲2011
[考研] 一志愿华工085600 331分 +6 天下ww 2026-04-09 6/300 2026-04-09 18:59 by l_paradox
[考研] 367求调剂 +10 hffQAQ 2026-04-09 10/500 2026-04-09 18:06 by lijunpoly
[考研] 复试调剂,一志愿郑州大学材料与化工289分 +31 硕星赴 2026-04-08 31/1550 2026-04-09 16:54 by Delta2012
[考研] 求助071001调剂!!! +7 黄守松 2026-04-05 8/400 2026-04-09 09:07 by 徐良白眉大侠
[考研] 求调剂 +8 吃口冰激凌 2026-04-07 8/400 2026-04-09 08:03 by 5268321
[考研] 材料调剂 +14 一样YWY 2026-04-06 14/700 2026-04-08 23:00 by 猪会飞
[考研] 0703化学调剂 348分 +14 唉我超真没招了 2026-04-06 15/750 2026-04-08 19:16 by 我减肥1
[考研] 085602调剂 初试总分335 +3 19123253302 2026-04-06 3/150 2026-04-07 18:00 by jp9609
[考研] 材料求调剂 +18 一样YWY 2026-04-05 18/900 2026-04-07 15:49 by dxlg
[考研] 机械专硕274求调剂,不挑专业学校 +6 泛泛2333 2026-04-05 8/400 2026-04-06 18:06 by 泛泛2333
[考研] 283求调剂 +5 baiiyu 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:35 by 啵啵啵0119
信息提示
请填处理意见