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高慧慧

新虫 (初入文坛)

[交流] 交流相关转录组 已有2人参与

已经有基因组,不同品系的一个植株不同器官混合样品测序转录组,在这些品系中能比较出来什么?求解
然后在以这些品系的转录组数据为参考,做表达谱~可是时间长啊~~转录组的数据在我的理解基本上就是废了!
又不能单独作文,接受混合测序结果有难度啊啊~!疯~!
个人有异议,想单独测序,那样数据更多,更有利于分析。
可是头儿是这么说的 ~部分原因是为了省钱,可是到时候啥都没有还要怪我~我改怎么办???
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
到我们公司来测呗,17000/lane(30G以上数据量)。
5楼2014-03-18 16:21:39
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woody196

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
如果是同一个物种的话是可以混到一起来进行转炉组测序的,不知道你是不是做了不同样品间的不同处理,这样相互对照肯定能够看出差别的,有些基因上调或者是下调很容易找到的,就是数据量比较大~
2楼2014-03-17 08:35:03
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高慧慧

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by woody196 at 2014-03-17 08:35:03
如果是同一个物种的话是可以混到一起来进行转炉组测序的,不知道你是不是做了不同样品间的不同处理,这样相互对照肯定能够看出差别的,有些基因上调或者是下调很容易找到的,就是数据量比较大~

没有什么特别处理就是那样单独的品系间的测序!
3楼2014-03-17 12:51:37
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woody196

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 高慧慧 at 2014-03-17 12:51:37
没有什么特别处理就是那样单独的品系间的测序!...

那你做此项研究有什么意义呢,同一个品系不做任何处理就是单纯的做一个转录组测序?你们主要是做什么方向的?
4楼2014-03-18 09:38:12
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