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呀薯条

金虫 (小有名气)

[求助] 如何计算引物的Tm值? 已有3人参与

primer 5 可以直接用来计算TM值吗?因为目的基因一样,所以我直接采用文献中的引物,现在要进行PCR,那Tm值如何确定?我在网上有看到Tm cacluator  网站,那里边的参数如何选择?其中product group 和下一行中的product 如何选择?如图所示,它们表示什么意思?
网址如下:https://www.neb.com/tools-and-re ... tools/tm-calculator
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  • 2014-03-05 16:09:36, 16 K

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yanfang2012

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
呀薯条: 金币+1, 有帮助 2014-03-05 19:19:13
primer5是可以对引物评估并给出Tm值的,合成引物的订单也会标示的
believe yourself!
2楼2014-03-05 19:09:31
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呀薯条

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yanfang2012 at 2014-03-05 19:09:31
primer5是可以对引物评估并给出Tm值的,合成引物的订单也会标示的

因为之前设计引物的时候,就大概记得有好几种引物可以选择,最后就选了一个,因为时间太久了,所以具体的温度就不记得了。不过还是谢谢啊。我后来解决这个问题了,我同学有个计算Tm的软件
3楼2014-03-05 19:20:35
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
呀薯条: 金币+1 2014-03-06 08:56:02
呀薯条(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖交流! 2014-03-31 01:00:03
我们拿到引物一般先跑个梯度选择好的温度,再跑PCR。
hehe
4楼2014-03-05 21:06:26
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wangpeng227

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
呀薯条: 金币+2, 有帮助 2014-03-06 08:56:14
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-03-31 00:59:55
需要根据酶来选择Tm值的计算方法,可以看一下酶的说明书。

一般使用Taq酶的Tm值计算方法:长度为25mer以下的引物,Tm计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)
5楼2014-03-05 21:14:58
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Jacob_24

木虫 (正式写手)

用Tm Utility
CCC
6楼2014-03-05 21:24:01
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