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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 转录组组装后的问题
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hnndpt

铁虫 (正式写手)

[交流] 转录组组装后的问题

HiSeq2000测得转录组，公司给拼接的。拼接好的unigene有一个列表，我们从列表中挑取了一些基因，发现有如下问题：
1. 两个unigene可以注释到Nr数据库中同一个蛋白上，我们把这连个unigene序列拿出来分析发现它们 反向互补。这种现象正常吗？因为发现好多这样的序列
2. HiSeq2000测序时候有没有测正义链和反义链之分？拼接结果考虑反向互补序列码？
新手，困惑啊！
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1楼 2014-02-08 03:54:24
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wsliuqiulei

铜虫 (初入文坛)
同样的问题，求解
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2楼2014-04-22 11:28:15
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