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铁虫 (正式写手)

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[交流] 转录组组装后的问题

HiSeq2000测得转录组，公司给拼接的。拼接好的unigene有一个列表，我们从列表中挑取了一些基因，发现有如下问题：
1. 两个unigene可以注释到Nr数据库中同一个蛋白上，我们把这连个unigene序列拿出来分析发现它们反向互补。这种现象正常吗？因为发现好多这样的序列
2. HiSeq2000测序时候有没有测正义链和反义链之分？拼接结果考虑反向互补序列码？
新手，困惑啊！

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1楼 2014-02-08 03:54:24

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wsliuqiulei

铜虫 (初入文坛)

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同样的问题，求解

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2楼2014-04-22 11:28:15

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