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转录组组装后的问题
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转录组组装后的问题
HiSeq2000测得转录组,公司给拼接的。拼接好的unigene有一个列表,我们从列表中挑取了一些基因,发现有如下问题:
1. 两个unigene可以注释到Nr数据库中同一个蛋白上,我们把这连个unigene序列拿出来分析发现它们 反向互补。这种现象正常吗?因为发现好多这样的序列
2. HiSeq2000测序时候有没有测正义链和反义链之分?拼接结果考虑反向互补序列码?
新手,困惑啊!
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