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木含24

木虫 (小有名气)

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[求助] 测序结果讨论已有2人参与

1、本人测了A物种的某段序列，经与NCBI比对，发现该序列与近缘物种B的某基因序列可以比对上，同源性高，但是它是与NCBI上提供的B的互补序列的反向序列有同源性（相同）。我本来觉得测序公司所给的结果应该是按照从5到3的顺序排列的，可这么一来又有点怀疑，到底对不对？如果是这个顺序，那么是不是说明其中一个物种的染色体在该序列附近发生交换？重组？还是怎么？

2、大家都说说如果拿到某物种的几个BAC克隆全长序列（每个有100多Kb），你会怎么做？怎么分析？怎么写文章？或者接下来怎么做实验？等等。

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1楼 2014-01-05 11:55:35

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gyl121

新虫 (正式写手)

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-01-05 15:12:04

楼主的情况刚好也是我所碰到的，我个人的观点：序列对应过来应该是重复片段，只是两边的引物区不同，也就是保守区的不同，建议楼主看下同源性比对的物种所用的引物与你是否相同？应该可以看出来问题，至于提到的重组，交换等，没考虑过，我也在摸索这个问题，可以交流下

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不经一番寒彻骨，怎得梅花扑鼻香？为科学进步不懈努力

2楼2014-01-05 12:40:54

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woshishui916

木虫 (著名写手)

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★ ★
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gyesang: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-01-05 15:12:12

测序公司给的序列正反向是随机的
建议你拿完整的序列
有BAC要做？？

[ 发自小木虫客户端 ]

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3楼2014-01-05 14:51:51

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木含24

木虫 (小有名气)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by gyl121 at 2014-01-05 12:40:54
楼主的情况刚好也是我所碰到的，我个人的观点：序列对应过来应该是重复片段，只是两边的引物区不同，也就是保守区的不同，建议楼主看下同源性比对的物种所用的引物与你是否相同？应该可以看出来问题，至于提到的重组 ...

哦，好的，谢谢

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4楼2014-01-06 14:38:44

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