应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 测序结果找不到引物
51/1返回列表
查看: 4267  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

柠檬可乐星

新虫 (小有名气)

[交流] 测序结果找不到引物

各位大神：我是做系统发育的，新手一枚，之前测了几个种的18S片段，大约1000bp，双向测序，是克隆后测序的。结果有一些能从测序结果中找到上游和下游引物，但大部分只能找到上游 或者下游引物，有的甚至上游和下游都找不到。但是在NCBI里blast，能确定这些是我做的属的。在网上看到不同的说法，有的说找不到引物说明没测通，有的说找不到引物属于正常，因为开头一二十个碱基经常测不准。所以我有三个疑问：
1、到底应该怎么看待测序结果中找不到引物序列这个问题？
2、这些序列可以用吗？
3、只看NCBI里blast的结果可靠吗？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2013-12-25 14:11:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

生物药学

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问你的测序结果是用snapgene软件处理的吗？如果在引物中找不到序列，可以直接在ncbi中blast吗

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2018-04-28 09:13:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

huahu3600

新虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 金币+4, 鼓励交流 2013-12-26 08:33:18
1，测序结果里面找不到该反应的测序引物是正常的
2，序列只要峰图正常就可以用，不过，一般头尾都会有杂峰等等
3，可靠的，

另外，给你个建议，可以用载体上的通用引物测序，这样，你整个片段的序列都可以看到了。
赞一下 回复此楼
2楼2013-12-25 15:10:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠檬可乐星

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by huahu3600 at 2013-12-25 15:10:01
1，测序结果里面找不到该反应的测序引物是正常的
2，序列只要峰图正常就可以用，不过，一般头尾都会有杂峰等等
3，可靠的，

另外，给你个建议，可以用载体上的通用引物测序，这样，你整个片段的序列都可以看到 ...

感谢您的指点，有一点忘记说了，我测序是用的通用引物，如果这样还找不到我自己的引物序列，是不是就不正常了呢？
赞一下 回复此楼
3楼2013-12-25 15:31:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huahu3600

新虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
柠檬可乐星: 金币+5 2013-12-26 16:28:41
引用回帖:
3楼: Originally posted by 柠檬可乐星 at 2013-12-25 15:31:50
感谢您的指点，有一点忘记说了，我测序是用的通用引物，如果这样还找不到我自己的引物序列，是不是就不正常了呢？...

那有可能通用引物离多克隆位点区太近了
你可以再往上游找找引物

呵呵，不要那么快否定实验结果。就算是这样，也有可能正常，比如可以结合下游的测序结果。
赞一下 回复此楼
4楼2013-12-25 15:42:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:28 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:52 by 4wMiSEwB6436
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 7/350 2026-08-15 00:40 by 4wMiSEwB6436
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 HFw0lei2R37i 2026-08-14 8/400 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +5 Ldrop2023 2026-08-13 5/250 2026-08-14 18:48 by ssxclkj
[基金申请] filecode +6 cratir 2026-08-14 10/500 2026-08-14 18:29 by 笑叹辞穷
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +5 工厂打螺丝 2026-08-08 5/250 2026-08-14 11:03 by 玖戈弋
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭