24小时热门版块排行榜    

查看: 710  |  回复: 1

kabuqinuo89

新虫 (小有名气)

[求助] 测序后证明克隆出非目的基因

我要做原核表达。
实验一开始是很顺利的,PCR得到目的基因片段(1000bp左右),回收,连接T载体,转化,最后提质粒,做酶切和PCR鉴定,都和目的片段相吻合,电泳跑出的条带也很不错。
可测序结果与我的参考序列一比对,完全不是目的片段,查找引物时,也只找到下游引物。
这足以说明我做出的东西完全不是我需要的。
我想是不是我的引物特异性不好?这对引物是从一篇文章中直接引用的。于是又用oligo分析了一下我的引物,各项指标都还可以,应该特异性很高的。实验中采用的退火温度也是完全按oligo的建议温度。
实验进行到这一步,我不知从什么地方找原因了。究竟哪会出问题呢?这是己经有人做过的,并且做出来了,有文章可查(国外的),为什么我做不出来呢?
下一步该怎么做,是不是需要从头再来,哪些地方要做什么样的调整?心里真是没谱儿……
请各位老师帮帮我,在此先谢过了。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 呵呵,鼓励交流哦。顺便说一下,第一个猫猫也是我最喜欢的。 2012-05-23 13:56:12
嗯.....................
       我觉得要是做验证的时候 不仅要做PCR还要酶切一下看看 这样才可靠
引物问题最好设计前BLAST一下 看有没有不同种之间的非特异扩增 这种事几率很小 但遇到了只能让人哭
       前些日子 本实验某人就遇到你这种情况 测序结果再BLAST发现东西是人皮肤上的某种蛋白.............老板脸色很难看 不注意预防污染就泪奔了
       遇到这种情况 只能从头来了 还是预祝孩子实验顺利吧 没有搞不定的实验的
Let God do with it as He wills
2楼2012-05-22 22:58:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kabuqinuo89 的主题更新
信息提示
请填处理意见