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wzw04

铁杆木虫 (小有名气)

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[求助] 比较转录组学分析问题已有3人参与

现有同一物种同一组织，不同发育阶段的转录组数据，如何进行分析呢？已知几个感兴趣的次生代谢物合成的基因，如何从转录组数据中筛选它们可能的调控基因？望大神们解惑啊！！！

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1楼 2013-12-24 15:17:48

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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★
wzw04: 金币+1, ★有帮助 2014-01-13 16:31:57

这个要看你想要得到什么，还有你的转录组数据具体是什么？

5楼2014-01-13 01:21:21

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ysx0226

金虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★ ★
wzw04: 金币+2, ★有帮助 2014-01-11 19:14:37

先blast再Go分类，再pathway分析，根据这些看看哪些基因和你的次生代谢基因同源性高，设计引物下一步

3楼2014-01-11 17:13:20

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wzw04

铁杆木虫 (小有名气)

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引用回帖:

3楼: Originally posted by ysx0226 at 2014-01-11 17:13:20
先blast再Go分类，再pathway分析，根据这些看看哪些基因和你的次生代谢基因同源性高，设计引物下一步

谢谢啊!

4楼2014-01-11 19:14:53

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wzw04

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引用回帖:

5楼: Originally posted by wizardfan at 2014-01-13 01:21:21
这个要看你想要得到什么，还有你的转录组数据具体是什么？

主要是想找到，植物体内次生代谢物变化相关的关键基因，但是如果按照发育阶段采样测序的话，不同阶段上调或下调的基因太多了，拿到数据后，不知道如何研究了。

6楼2014-01-13 16:34:07

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