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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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wzw04

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 比较转录组学分析问题 已有3人参与

现有同一物种同一组织,不同发育阶段的转录组数据,如何进行分析呢?已知几个感兴趣的次生代谢物合成的基因,如何从转录组数据中筛选它们可能的调控基因?望大神们解惑啊!!!
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wzw04

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ysx0226 at 2014-01-11 17:13:20
先blast再Go分类,再pathway分析,根据这些看看哪些基因和你的次生代谢基因同源性高,设计引物下一步

谢谢啊!
4楼2014-01-11 19:14:53
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ysx0226

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
wzw04: 金币+2, 有帮助 2014-01-11 19:14:37
先blast再Go分类,再pathway分析,根据这些看看哪些基因和你的次生代谢基因同源性高,设计引物下一步
3楼2014-01-11 17:13:20
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖


wzw04: 金币+1, 有帮助 2014-01-13 16:31:57
这个要看你想要得到什么,还有你的转录组数据具体是什么?
5楼2014-01-13 01:21:21
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wzw04

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wizardfan at 2014-01-13 01:21:21
这个要看你想要得到什么,还有你的转录组数据具体是什么?

主要是想找到,植物体内次生代谢物变化相关的关键基因,但是如果按照发育阶段采样测序的话,不同阶段上调或下调的基因太多了,拿到数据后,不知道如何研究了。
6楼2014-01-13 16:34:07
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