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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 比较转录组学分析问题
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wzw04

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 比较转录组学分析问题 已有3人参与

现有同一物种同一组织，不同发育阶段的转录组数据，如何进行分析呢？已知几个感兴趣的次生代谢物合成的基因，如何从转录组数据中筛选它们可能的调控基因？望大神们解惑啊！！！
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1楼 2013-12-24 15:17:48
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ysx0226

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
wzw04: 金币+2, ★有帮助 2014-01-11 19:14:37
先blast再Go分类，再pathway分析，根据这些看看哪些基因和你的次生代谢基因同源性高，设计引物下一步
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3楼2014-01-11 17:13:20
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wzw04

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ysx0226 at 2014-01-11 17:13:20
先blast再Go分类，再pathway分析，根据这些看看哪些基因和你的次生代谢基因同源性高，设计引物下一步

谢谢啊!
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4楼2014-01-11 19:14:53
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
wzw04: 金币+1, ★有帮助 2014-01-13 16:31:57
这个要看你想要得到什么，还有你的转录组数据具体是什么？
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5楼2014-01-13 01:21:21
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wzw04

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wizardfan at 2014-01-13 01:21:21
这个要看你想要得到什么，还有你的转录组数据具体是什么？

主要是想找到，植物体内次生代谢物变化相关的关键基因，但是如果按照发育阶段采样测序的话，不同阶段上调或下调的基因太多了，拿到数据后，不知道如何研究了。
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6楼2014-01-13 16:34:07
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