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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 求助有关蛋白同源性问题
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小虫友

金虫 (小有名气)

[求助] 求助有关蛋白同源性问题已有1人参与

最近比对了一个菌蛋白和人相似蛋白的同源性为27%。想请问高手们：如果把这个蛋白作为未来药物作用靶点，会不会因为与人的同源性而产生副作用呢？同源性多少才算高，多少才算可以接受呢？
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1楼2013-12-23 14:39:44
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Allen206

银虫 (小有名气)
同源性是指序列相同部分占总序列的比例么？
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不想说什么，，，，
2楼2013-12-23 15:39:35
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小虫友

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Allen206 at 2013-12-23 15:39:35
同源性是指序列相同部分占总序列的比例么？

我也是这样理解的。
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3楼2013-12-23 15:43:30
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小虫友(kx444555代发): 金币+3, 鼓励交流 2013-12-24 08:22:44
小虫友: 金币+5, ★有帮助 2013-12-26 14:01:56
27%是比较低的。你需要引入更多的序列，如果有晶体结构，最好做structure based alignment，比较active site的保守性。
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4楼2013-12-24 02:15:56
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