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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » NCBI里blast的E value是什么意思？
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柠檬可乐星

新虫 (小有名气)

[求助] NCBI里blast的E value是什么意思？ 已有2人参与

各位大虾：我刚刚开始做系统发育方面的问题，很多东西都还没有概念，现在测出来18S的一段序列，在NCBI里blast，不知道该怎么看这几个指标：Max score、total score、query cover、E value、ident。另外，E value是什么意思啊？
新手上路，求指点！
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1楼 2013-12-17 11:28:28
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上官雨昕9

新虫 (初入文坛)
那结果中ident时什么意思啊？

发自小木虫Android客户端
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4楼2018-05-14 19:15:05
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
柠檬可乐星: 金币+2 2013-12-17 21:12:33
E Value就是期望值 expect value，这个值越小表示序列相似性越大，这个值反应的是blast结果某个序列是系统随机给出的概率--可以这么理解
赞一下(2人) 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-12-17 13:51:05
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tjufeixiang

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 金币+2, MolEPI+1, 鼓励发帖交流！ 2013-12-17 20:35:47
柠檬可乐星: 金币+3 2013-12-17 21:12:38
E-Value 是指在随机情况下，获得比当前比对分数相等或更高分数的可能比对条数。
一般E>1说明偶然性较高
E<0.1 or 0.05 说明具有结果具有统计学特征
E<0.00001说明两比对结果高度相似
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3楼2013-12-17 16:28:18
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