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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请问，Pymol软件可以用于分子动态模拟吗？谢谢！
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wen530

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 请问，Pymol软件可以用于分子动态模拟吗？谢谢！

各位前辈，我想请问一下，Pymol软件可用于动态分子模拟吗，能进行蛋白质与已知结构的小分子的相互作用的模拟吗？还有哪些软件可以用于动态分子模拟？非常感谢大家的回复！
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1楼 2013-11-28 21:06:04
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黑藻先生

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-05 00:51:47
Pymol主要是用于可视化

动态模拟的DOCK方面AUTODOCK等
MD：AMBER GROMACS NAMD 等等
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2楼2013-12-04 20:52:29
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Sean2010

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-05 00:51:54
Pymol和许多visualisation software一样是用于查看，修改pdb文件以便于进行模拟的软件，同类软件还有VMD、Chimera等。个人所学，VMD和Chimera是Linux系统下的软件，Pymol可以装在Windows下，但是貌似有软件自身的code要学。
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自强弘毅，求是拓新
3楼2013-12-04 23:54:49
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