24小时热门版块排行榜    

查看: 1981  |  回复: 6

zfcxf915

木虫 (小有名气)

[求助] 请问用分子对接能否模拟含有金属离子的体系,谢谢

各位专家,我想模拟DNA与金属离子(如铜离子、镍离子),小分子药物之间的相互作用,请问用sybyl能否模拟含有金属离子的体系,谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxdcs1010

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zfcxf915: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-04 11:00:24
zfcxf915: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-06 08:10:23
不能,flexX就是一鸡肋,因为其是商业软件,所以不能修改参数,导致你的金属离子不能识别,autodock是个不错的选择

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-05-04 10:28:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxdcs1010

木虫 (正式写手)

对啦,好像flexX连DNA都无法识别吧,flexX早期版本只能做蛋白质
3楼2013-05-04 10:32:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfcxf915

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zxdcs1010 at 2013-05-04 10:28:15
不能,flexX就是一鸡肋,因为其是商业软件,所以不能修改参数,导致你的金属离子不能识别,autodock是个不错的选择

您好,请问autodock可以识别金属离子和DNA这个体系是吗?
4楼2013-05-04 11:00:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxdcs1010

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zfcxf915 at 2013-05-04 11:00:09
您好,请问autodock可以识别金属离子和DNA这个体系是吗?...

嗯,是的。autodock可以识别大多数的常见的金属离子,你提到的铜离子肯定识别、镍离子我没有印象,即使不识别,你自己也可添加镍离子的参数,因为autodock是开源的。
5楼2013-05-05 10:51:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfcxf915

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zxdcs1010 at 2013-05-05 10:51:54
嗯,是的。autodock可以识别大多数的常见的金属离子,你提到的铜离子肯定识别、镍离子我没有印象,即使不识别,你自己也可添加镍离子的参数,因为autodock是开源的。...

谢谢!
6楼2013-05-06 08:09:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lipeng43

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zxdcs1010 at 2013-05-04 10:28:15
不能,flexX就是一鸡肋,因为其是商业软件,所以不能修改参数,导致你的金属离子不能识别,autodock是个不错的选择

请问autodock金属怎么和分子对接?

发自小木虫Android客户端
7楼2017-04-03 17:33:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zfcxf915 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 中科院材料273求调剂 +3 yzydy 2026-03-15 3/150 2026-03-15 21:15 by ms629
[考研] 机械专硕调剂 +3 笨笨兔子 2026-03-12 3/150 2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考博] 欢迎申博同学联系 +3 天道酬勤2026686 2026-03-10 7/350 2026-03-15 19:03 by 天道酬勤2026686
[考研] 材料专硕326求调剂 +4 墨煜姒莘 2026-03-15 4/200 2026-03-15 11:02 by dyw
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy! 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 288求调剂 +14 王晓阳- 2026-03-09 19/950 2026-03-14 02:05 by JourneyLucky
[考研] 085600求调剂 +3 a邵星池 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:32 by JourneyLucky
[考研] b区环境工程求调剂 +4 Maps1 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:23 by JourneyLucky
[考研] 材料371求调剂 +9 鳄鱼? 2026-03-11 11/550 2026-03-13 22:53 by JourneyLucky
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 5/250 2026-03-13 22:06 by 星空星月
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +3 miaodesi 2026-03-12 4/200 2026-03-13 20:53 by 18595523086
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +4 薛云鹏 2026-03-13 4/200 2026-03-13 10:40 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 资源与环境 285 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:31 by houyaoxu
[考研] 085600 材料与化工 295 求调剂 +10 dream…… 2026-03-10 12/600 2026-03-12 13:46 by dream……
[考研] 0857环境调剂 +5 熠熠_11 2026-03-10 5/250 2026-03-11 10:59 by wang_dand
[考研] 293求调剂,一志愿陕师大生物学 +3 ??????.?.??? 2026-03-09 3/150 2026-03-11 10:02 by 学员8dgXkO
信息提示
请填处理意见