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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请问用分子对接能否模拟含有金属离子的体系，谢谢
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zfcxf915

木虫 (小有名气)

[求助] 请问用分子对接能否模拟含有金属离子的体系，谢谢

各位专家，我想模拟DNA与金属离子（如铜离子、镍离子），小分子药物之间的相互作用，请问用sybyl能否模拟含有金属离子的体系，谢谢
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1楼 2013-05-04 09:40:51
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lipeng43

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zxdcs1010 at 2013-05-04 10:28:15
不能，flexX就是一鸡肋，因为其是商业软件，所以不能修改参数，导致你的金属离子不能识别，autodock是个不错的选择

请问autodock金属怎么和分子对接？

发自小木虫Android客户端
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7楼2017-04-03 17:33:38
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zxdcs1010

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zfcxf915: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-04 11:00:24
zfcxf915: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-06 08:10:23
不能，flexX就是一鸡肋，因为其是商业软件，所以不能修改参数，导致你的金属离子不能识别，autodock是个不错的选择
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lipeng43
2楼2013-05-04 10:28:15
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zxdcs1010

木虫 (正式写手)
对啦，好像flexX连DNA都无法识别吧，flexX早期版本只能做蛋白质
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3楼2013-05-04 10:32:34
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zfcxf915

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zxdcs1010 at 2013-05-04 10:28:15
不能，flexX就是一鸡肋，因为其是商业软件，所以不能修改参数，导致你的金属离子不能识别，autodock是个不错的选择

您好，请问autodock可以识别金属离子和DNA这个体系是吗？
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4楼2013-05-04 11:00:09
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