24小时热门版块排行榜    

查看: 1990  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zfcxf915

木虫 (小有名气)

[求助] 请问用分子对接能否模拟含有金属离子的体系,谢谢

各位专家,我想模拟DNA与金属离子(如铜离子、镍离子),小分子药物之间的相互作用,请问用sybyl能否模拟含有金属离子的体系,谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfcxf915

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zxdcs1010 at 2013-05-04 10:28:15
不能,flexX就是一鸡肋,因为其是商业软件,所以不能修改参数,导致你的金属离子不能识别,autodock是个不错的选择

您好,请问autodock可以识别金属离子和DNA这个体系是吗?
4楼2013-05-04 11:00:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

zxdcs1010

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zfcxf915: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-04 11:00:24
zfcxf915: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-06 08:10:23
不能,flexX就是一鸡肋,因为其是商业软件,所以不能修改参数,导致你的金属离子不能识别,autodock是个不错的选择

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-05-04 10:28:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxdcs1010

木虫 (正式写手)

对啦,好像flexX连DNA都无法识别吧,flexX早期版本只能做蛋白质
3楼2013-05-04 10:32:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxdcs1010

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zfcxf915 at 2013-05-04 11:00:09
您好,请问autodock可以识别金属离子和DNA这个体系是吗?...

嗯,是的。autodock可以识别大多数的常见的金属离子,你提到的铜离子肯定识别、镍离子我没有印象,即使不识别,你自己也可添加镍离子的参数,因为autodock是开源的。
5楼2013-05-05 10:51:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +4 Ymlll 2026-03-18 6/300 2026-03-18 22:15 by li123456789.
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +5 小材化本科 2026-03-18 5/250 2026-03-18 21:53 by 无懈可击111
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +7 Liwangman 2026-03-15 7/350 2026-03-18 20:08 by walc
[考研] 0703化学 305求调剂 +3 FY_yy 2026-03-14 3/150 2026-03-18 19:40 by macy2011
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +5 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 6/300 2026-03-18 17:53 by 无际的草原
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[基金申请] 被我言中:新模板不强调格式了,假专家开始管格式了 +4 beefly 2026-03-14 4/200 2026-03-17 22:04 by 黄鸟于飞Chao
[考研] 301求调剂 +4 A_JiXing 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:32 by ruiyingmiao
[考研] 085600材料与化工求调剂 +5 绪幸与子 2026-03-17 5/250 2026-03-17 16:40 by laoshidan
[考研] 机械专硕325,寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 材料080500调剂求收留 +3 一颗meteor 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:54 by peike
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
信息提示
请填处理意见