应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请问用分子对接能否模拟含有金属离子的体系，谢谢
71/1返回列表
查看: 2004  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zfcxf915

木虫 (小有名气)

[求助] 请问用分子对接能否模拟含有金属离子的体系，谢谢

各位专家，我想模拟DNA与金属离子（如铜离子、镍离子），小分子药物之间的相互作用，请问用sybyl能否模拟含有金属离子的体系，谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-05-04 09:40:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxdcs1010

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zfcxf915: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-04 11:00:24
zfcxf915: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-06 08:10:23
不能，flexX就是一鸡肋，因为其是商业软件，所以不能修改参数，导致你的金属离子不能识别，autodock是个不错的选择
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

lipeng43
2楼2013-05-04 10:28:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxdcs1010

木虫 (正式写手)
对啦，好像flexX连DNA都无法识别吧，flexX早期版本只能做蛋白质
赞一下 回复此楼
3楼2013-05-04 10:32:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfcxf915

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zxdcs1010 at 2013-05-04 10:28:15
不能，flexX就是一鸡肋，因为其是商业软件，所以不能修改参数，导致你的金属离子不能识别，autodock是个不错的选择

您好，请问autodock可以识别金属离子和DNA这个体系是吗？
赞一下 回复此楼
4楼2013-05-04 11:00:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxdcs1010

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zfcxf915 at 2013-05-04 11:00:09
您好，请问autodock可以识别金属离子和DNA这个体系是吗？...

嗯，是的。autodock可以识别大多数的常见的金属离子，你提到的铜离子肯定识别、镍离子我没有印象，即使不识别，你自己也可添加镍离子的参数，因为autodock是开源的。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2013-05-05 10:51:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfcxf915

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zxdcs1010 at 2013-05-05 10:51:54
嗯，是的。autodock可以识别大多数的常见的金属离子，你提到的铜离子肯定识别、镍离子我没有印象，即使不识别，你自己也可添加镍离子的参数，因为autodock是开源的。...

谢谢！
回复此楼
6楼2013-05-06 08:09:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lipeng43

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zxdcs1010 at 2013-05-04 10:28:15
不能，flexX就是一鸡肋，因为其是商业软件，所以不能修改参数，导致你的金属离子不能识别，autodock是个不错的选择

请问autodock金属怎么和分子对接？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
7楼2017-04-03 17:33:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zfcxf915 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿中南化学（0703）总分337求调剂 +9 niko- 2026-03-19 10/500 2026-03-22 16:08 by ColorlessPI
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-20 3/150 2026-03-22 16:00 by ColorlessPI
[考研] 319求调剂 +4 小力气珂珂 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:53 by ColorlessPI
[考研] 环境学硕288求调剂 +5 皮皮皮123456 2026-03-22 5/250 2026-03-22 15:27 by 无懈可击111
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +4 www_q 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 268求调剂 +9 简单点0 2026-03-17 9/450 2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 323求调剂 +3 洼小桶 2026-03-18 3/150 2026-03-20 22:54 by JourneyLucky
[考研] 求调剂，一志愿:南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +4 @taotao 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:14 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工 322求调剂 +4 然11 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:12 by luoyongfeng
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +11 Ymlll 2026-03-18 15/750 2026-03-20 19:40 by 丁丁*
[考研] 085600材料与化工求调剂 +6 绪幸与子 2026-03-17 6/300 2026-03-19 13:27 by houyaoxu
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭