24小时热门版块排行榜    

查看: 2007  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zfcxf915

木虫 (小有名气)

[求助] 请问用分子对接能否模拟含有金属离子的体系,谢谢

各位专家,我想模拟DNA与金属离子(如铜离子、镍离子),小分子药物之间的相互作用,请问用sybyl能否模拟含有金属离子的体系,谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfcxf915

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zxdcs1010 at 2013-05-05 10:51:54
嗯,是的。autodock可以识别大多数的常见的金属离子,你提到的铜离子肯定识别、镍离子我没有印象,即使不识别,你自己也可添加镍离子的参数,因为autodock是开源的。...

谢谢!
6楼2013-05-06 08:09:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

zxdcs1010

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zfcxf915: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-04 11:00:24
zfcxf915: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-06 08:10:23
不能,flexX就是一鸡肋,因为其是商业软件,所以不能修改参数,导致你的金属离子不能识别,autodock是个不错的选择

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-05-04 10:28:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxdcs1010

木虫 (正式写手)

对啦,好像flexX连DNA都无法识别吧,flexX早期版本只能做蛋白质
3楼2013-05-04 10:32:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfcxf915

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zxdcs1010 at 2013-05-04 10:28:15
不能,flexX就是一鸡肋,因为其是商业软件,所以不能修改参数,导致你的金属离子不能识别,autodock是个不错的选择

您好,请问autodock可以识别金属离子和DNA这个体系是吗?
4楼2013-05-04 11:00:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿东华大学化学070300,求调剂 +7 2117205181 2026-03-21 8/400 2026-03-22 22:55 by chixmc
[考研] 环境学硕288求调剂 +6 皮皮皮123456 2026-03-22 6/300 2026-03-22 16:52 by i_cooler
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考! +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +22 rare12345 2026-03-18 22/1100 2026-03-20 20:39 by zhukairuo
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工专硕调剂 +7 heming3743 2026-03-16 7/350 2026-03-20 19:31 by zhukairuo
[考研] 环境工程调剂 +9 大可digkids 2026-03-16 9/450 2026-03-20 17:38 by 醉在风里
[考研] 广西大学家禽遗传育种课题组2026年硕士招生(接收计算机专业调剂) +3 123阿标 2026-03-17 3/150 2026-03-20 15:58 by 飞行琦
[考研] 085410人工智能专硕317求调剂(0854都可以) +4 xbxudjdn 2026-03-18 4/200 2026-03-20 09:07 by 不168
[考研] 081700化工学硕调剂 +3 【1】 2026-03-16 3/150 2026-03-19 23:40 by edmund7
[考研] 材料工程专硕调剂 +5 204818@lcx 2026-03-17 6/300 2026-03-18 22:55 by 204818@lcx
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
信息提示
请填处理意见