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永远一片天

新虫 (正式写手)

[求助] 如何利用文献找到的引物查找目的模板？

如何利用文献找到的引物查找目的模板？验证引物的特异性和正确性··
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1楼 2013-11-21 18:21:17
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soarrow

铁杆木虫 (正式写手)

酱油歪楼党
引用回帖:
3楼: Originally posted by 永远一片天 at 2013-11-21 19:57:56
可是，会有好多模板的，我不知道要选哪一个？比如，上CAACCGTACAGAATGAAGCGG
下TTATTCGTGCAATACTCGTGCG...

汗，选择跟自己研究方向有关的，或者是周围能找得到的or买得到的
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4楼2013-11-21 21:39:43
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soarrow

铁杆木虫 (正式写手)

酱油歪楼党

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
永远一片天: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-11-21 19:56:57
还是blast，选择blastn
引物，上游和下游一起输入，中间空几个---
database 选择 Others
Optimize for 选择 Somewhat similar sequences.....

比对出来的数据就能进一步找到你想要的信息，包括模板序列等等等等
赞一下 回复此楼
2楼2013-11-21 19:12:46
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永远一片天

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by soarrow at 2013-11-21 19:12:46
还是blast，选择blastn
引物，上游和下游一起输入，中间空几个---
database 选择 Others
Optimize for 选择 Somewhat similar sequences.....

比对出来的数据就能进一步找到你想要的信息，包括模板序列等等等 ...

可是，会有好多模板的，我不知道要选哪一个？比如，上CAACCGTACAGAATGAAGCGG
下TTATTCGTGCAATACTCGTGCG
赞一下 回复此楼
3楼2013-11-21 19:57:56
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jingmi

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by soarrow at 2013-11-21 19:12:46
还是blast，选择blastn
引物，上游和下游一起输入，中间空几个---
database 选择 Others
Optimize for 选择 Somewhat similar sequences.....

比对出来的数据就能进一步找到你想要的信息，包括模板序列等等等 ...

请问您输入的是下游引物的反向互补序列吗
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5楼2015-01-09 16:43:11
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