24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 836  |  回复: 2

1054950560

金虫 (正式写手)

[求助] 关于约束优化时蛋白质残基的编号问题

我想对一个蛋白质结构进行优化,使用的amber软件。从pdb数据库上下载是蛋白质的残基编号是9-89,然后对其进行处理。top文件什么的都已经生成,当对其进行约束优化填写氨基酸残基编号时,我犹豫了,不知道是写9-89呢,还是写1-81。然后以后的分析都牵扯到残基编号问题,求解惑。是按pdb数据库的编号还是从1从新开始编号,谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

努力就会有回报,不管是好的还是坏的
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qingtian510

银虫 (初入文坛)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-21 15:17:06
默认的是从1开始的
奋斗吧,少年
2楼2013-11-21 09:50:50
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1054950560

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by qingtian510 at 2013-11-21 09:50:50
默认的是从1开始的

嗯,是的,以后的操作就得改变原子编号了,谢谢
努力就会有回报,不管是好的还是坏的
3楼2013-11-21 15:44:01
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 1054950560 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求材料调剂,一志愿郑州大学289分 +15 硕星赴 2026-04-03 15/750 2026-04-04 01:01 by userper
[考研] 283求调剂 +5 A child 2026-03-28 5/250 2026-04-04 00:40 by userper
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-04-02 11/550 2026-04-03 23:46 by hemengdong
[考研] 311(085601)求调剂 +15 liziyeyeye 2026-03-28 16/800 2026-04-03 21:43 by qlm5820
[考研] 335求调剂 +7 沈清璃 2026-04-03 7/350 2026-04-03 18:55 by lijunpoly
[考研] 372分材料与化工(085600)一志愿湖南大学求调剂 +3 蓝笺片 2026-04-03 4/200 2026-04-03 17:58 by Jimmyandyou
[考研] 366求调剂 +7 sbdnd 2026-04-03 7/350 2026-04-03 12:40 by cymywx
[考研] 289求调剂 +4 Acesczlo 2026-03-29 5/250 2026-04-03 10:09 by 不168
[考研] 326求调剂 +3 9ahye 2026-04-02 4/200 2026-04-03 08:43 by Jaylen.
[考研] 材料专硕322分 +10 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-02 10/500 2026-04-02 21:46 by dongzh2009
[考研] 材料340分调剂 +7 夏夜晚风_long 2026-04-02 9/450 2026-04-02 21:20 by dongzh2009
[考研] 求调剂 302分初试 0854 +5 伶可乐 2026-04-02 5/250 2026-04-02 17:53 by 笔落锦州
[考研] 354求调剂 +4 lxb598 2026-03-31 5/250 2026-04-02 09:55 by Jaylen.
[考研] 材料求调剂 +8 呢呢妮妮 2026-04-01 8/400 2026-04-02 07:13 by yjolah
[考研] 298求调剂 +4 什么是胖头鱼 2026-03-30 6/300 2026-04-01 22:06 by 客尔美德
[考研] 086000生物与医药298调剂求助 +4 元元青青 2026-03-31 6/300 2026-04-01 11:13 by syh9288
[考研] 0856调剂 +7 曲听筠 2026-03-30 7/350 2026-04-01 08:51 by JourneyLucky
[考研] 调剂申请 +8 张张张张zy 2026-03-31 9/450 2026-04-01 08:29 by zjbkx
[考研] 0856求调剂 +9 楒桉 2026-03-28 9/450 2026-03-31 19:06 by 暮泽12
[考研] 070300化学354求调剂 +15 101次希望 2026-03-28 15/750 2026-03-31 17:58 by jp9609
信息提示
请填处理意见