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1054950560

金虫 (正式写手)

[求助] 关于约束优化时蛋白质残基的编号问题

我想对一个蛋白质结构进行优化，使用的amber软件。从pdb数据库上下载是蛋白质的残基编号是9-89，然后对其进行处理。top文件什么的都已经生成，当对其进行约束优化填写氨基酸残基编号时，我犹豫了，不知道是写9-89呢，还是写1-81。然后以后的分析都牵扯到残基编号问题，求解惑。是按pdb数据库的编号还是从1从新开始编号，谢谢
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努力就会有回报，不管是好的还是坏的
1楼 2013-11-21 08:49:48
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qingtian510

银虫 (初入文坛)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-11-21 15:17:06
默认的是从1开始的
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奋斗吧，少年
2楼2013-11-21 09:50:50
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1054950560

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by qingtian510 at 2013-11-21 09:50:50
默认的是从1开始的

嗯，是的，以后的操作就得改变原子编号了，谢谢
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努力就会有回报，不管是好的还是坏的
3楼2013-11-21 15:44:01
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