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金虫 (正式写手)

[求助] 关于约束优化时蛋白质残基的编号问题

我想对一个蛋白质结构进行优化,使用的amber软件。从pdb数据库上下载是蛋白质的残基编号是9-89,然后对其进行处理。top文件什么的都已经生成,当对其进行约束优化填写氨基酸残基编号时,我犹豫了,不知道是写9-89呢,还是写1-81。然后以后的分析都牵扯到残基编号问题,求解惑。是按pdb数据库的编号还是从1从新开始编号,谢谢
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努力就会有回报,不管是好的还是坏的
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qingtian510

银虫 (初入文坛)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-21 15:17:06
默认的是从1开始的
奋斗吧,少年
2楼2013-11-21 09:50:50
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1054950560

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by qingtian510 at 2013-11-21 09:50:50
默认的是从1开始的

嗯,是的,以后的操作就得改变原子编号了,谢谢
努力就会有回报,不管是好的还是坏的
3楼2013-11-21 15:44:01
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